More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1532 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  100 
 
 		 360 aa  732    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  76.39 
 
 		 365 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0375  sugar ABC transporter ATP-binding protein  68.23 
 
 		 364 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445668  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0339  ABC transporter related  68.23 
 
 		 364 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.835031  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  53.35 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.65 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.63 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.93 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.32 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  53.57 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.07 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.73 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  53.99 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  54.27 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  52.43 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  52.35 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  54.02 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  52.35 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.64 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.23 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  54.19 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50.95 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.14 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  54.02 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.33 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  52.35 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.47 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  51.01 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  53.15 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  50.51 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.92 
 
 		 370 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  49.73 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  51.72 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.45 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.18 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  51.8 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  52.73 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.91 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.02 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  53.28 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  51.21 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  50.27 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  50.82 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.35 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  51.94 
 
 		 585 aa  364  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.25 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.25 
 
 		 362 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  50.13 
 
 		 380 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 371 aa  363  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  52.62 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  56.46 
 
 		 366 aa  362  4e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  56.46 
 
 		 366 aa  362  4e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.38 
 
 		 354 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  50.27 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.69 
 
 		 361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.69 
 
 		 361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.69 
 
 		 361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  50.27 
 
 		 367 aa  361  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.07 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.67 
 
 		 349 aa  360  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  48.87 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  49.61 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.72 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.72 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.42 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  50.69 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  50.68 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  49.35 
 
 		 375 aa  357  9.999999999999999e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  50.96 
 
 		 362 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  50.69 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  50.56 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  49.35 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.54 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  51.93 
 
 		 354 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.808152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>