More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3512 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
362 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  96.96 
 
 
362 aa  718    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  82.64 
 
 
363 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.45 
 
 
361 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.45 
 
 
360 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.18 
 
 
360 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.18 
 
 
360 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  76.52 
 
 
361 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  76.52 
 
 
361 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  76.24 
 
 
361 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  76.18 
 
 
361 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  75.62 
 
 
361 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  75.9 
 
 
361 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3694  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.39 
 
 
360 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.39 
 
 
360 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.39 
 
 
360 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.39 
 
 
360 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  78.39 
 
 
360 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  65.83 
 
 
356 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.11 
 
 
356 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  65.56 
 
 
356 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  65.28 
 
 
356 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  65.28 
 
 
356 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  65.56 
 
 
356 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.2 
 
 
357 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  65.56 
 
 
356 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  65 
 
 
356 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  65.56 
 
 
357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  65.28 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.11 
 
 
358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  67.58 
 
 
357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  65.28 
 
 
356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.11 
 
 
356 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.11 
 
 
356 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.67 
 
 
357 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.11 
 
 
356 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.2 
 
 
356 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.67 
 
 
357 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.11 
 
 
356 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  65.28 
 
 
358 aa  461  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  66.39 
 
 
357 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.73 
 
 
349 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.63 
 
 
369 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.79 
 
 
367 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.74 
 
 
365 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  59.29 
 
 
365 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.11 
 
 
353 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.56 
 
 
365 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.79 
 
 
349 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.79 
 
 
349 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  57.1 
 
 
335 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  57.42 
 
 
335 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  56.33 
 
 
345 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  58.08 
 
 
340 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.25 
 
 
351 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  57.69 
 
 
335 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.33 
 
 
369 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  53.61 
 
 
355 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  57.34 
 
 
338 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  53.33 
 
 
356 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 
381 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  53.99 
 
 
357 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  52.78 
 
 
355 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.06 
 
 
369 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  55.98 
 
 
336 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.02 
 
 
359 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  53.59 
 
 
354 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  52.6 
 
 
363 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.7 
 
 
360 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.66 
 
 
354 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  53.85 
 
 
357 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  53.31 
 
 
354 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  53.02 
 
 
359 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  54.44 
 
 
355 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.6 
 
 
363 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  53.15 
 
 
360 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  52.2 
 
 
385 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.22 
 
 
355 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  52.62 
 
 
352 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  55.41 
 
 
370 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  52.35 
 
 
353 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  54.44 
 
 
353 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.03 
 
 
366 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  51.25 
 
 
360 aa  363  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  52.19 
 
 
360 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.25 
 
 
349 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  52.05 
 
 
355 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.1 
 
 
356 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  53.04 
 
 
368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.5 
 
 
352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  51.91 
 
 
360 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  51.1 
 
 
366 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 
373 aa  361  9e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  52.09 
 
 
368 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.08 
 
 
369 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  53.31 
 
 
370 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  51.94 
 
 
374 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  51.23 
 
 
355 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
370 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  51.1 
 
 
366 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>