More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2078 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 349 aa  711    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  59.83 
 
 		 357 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  58.12 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  57.55 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  55.56 
 
 		 385 aa  394  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.68 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.33 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  52.37 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.65 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.32 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.11 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.6 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.6 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.17 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.15 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  53.78 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.95 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.76 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.03 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.04 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.76 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.06 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.78 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.47 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  59.25 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.78 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.06 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.47 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.06 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.09 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.17 
 
 		 351 aa  362  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3694  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.75 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  52.79 
 
 		 356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 		 356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 		 356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  52.79 
 
 		 356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.61 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  51.67 
 
 		 360 aa  360  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.75 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  50.83 
 
 		 366 aa  359  3e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.75 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.75 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.75 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 356 aa  358  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.24 
 
 		 349 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.09 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 365 aa  358  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.67 
 
 		 365 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.67 
 
 		 365 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.07 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.51 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.5 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  53.44 
 
 		 354 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.95 
 
 		 349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.41 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.53 
 
 		 358 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.96 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.96 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.67 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.96 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  52.09 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.96 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.71 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  53.41 
 
 		 352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  53.67 
 
 		 335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  53.22 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  53.22 
 
 		 355 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.68 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 368 aa  352  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  53.67 
 
 		 335 aa  352  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 		 348 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.31 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  52.25 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0375  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.69 
 
 		 369 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 371 aa  348  8e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0339  ABC transporter related  50.96 
 
 		 364 aa  348  8e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.835031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  52.94 
 
 		 345 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  53.24 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.21 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50.27 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  53.24 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.28 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  49.18 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.84 
 
 		 357 aa  346  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  53.52 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 364 aa  346  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  51.81 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2348  ABC transporter related  51.14 
 
 		 368 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.917479  normal  0.103865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.27 
 
 		 369 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  51.77 
 
 		 357 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>