More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3647 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  87.85 
 
 		 354 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  100 
 
 		 355 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  88.14 
 
 		 354 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  87.29 
 
 		 354 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  82.66 
 
 		 345 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  68.25 
 
 		 358 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  68.36 
 
 		 353 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  68.36 
 
 		 355 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  66.67 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  67.51 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  66.76 
 
 		 355 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  67.23 
 
 		 353 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  64.97 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  68.17 
 
 		 354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  66.76 
 
 		 353 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  66.01 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  64.51 
 
 		 355 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  65.9 
 
 		 353 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  64.61 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  64.33 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  63.94 
 
 		 355 aa  457  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  63.66 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  63.53 
 
 		 350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  62.82 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  66.3 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  64.95 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  61.86 
 
 		 355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  61.94 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  62.36 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  62.36 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  60.85 
 
 		 351 aa  438  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  60.68 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  62.36 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  60.77 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.87 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  56.3 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.6 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  54.87 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  55.15 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  53.11 
 
 		 354 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  55.74 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  55.9 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.98 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.64 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.32 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  55.52 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.42 
 
 		 351 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  54.04 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  56.67 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.39 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  53.35 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.39 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  54.92 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.15 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.11 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.83 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.15 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.39 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.28 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.28 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.28 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.28 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.83 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3694  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.67 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.11 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  52.46 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  56.58 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  54.22 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.11 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.11 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.11 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  53.68 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.42 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.06 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  54.06 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.28 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5401  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.1 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  53.5 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  54.44 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  52.1 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  53.04 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.96 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  52.89 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  55.59 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.69 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  52.69 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.15 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  50.82 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.91 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.91 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.94 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  52.69 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.4 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  52.69 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  53.52 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  54.77 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>