More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4511 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  100 
 
 
356 aa  718    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  67.8 
 
 
357 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  66.76 
 
 
357 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  67.14 
 
 
356 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  56.86 
 
 
356 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  55.74 
 
 
356 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  58.26 
 
 
355 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  55.34 
 
 
354 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  57.58 
 
 
355 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  57.88 
 
 
352 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  53.93 
 
 
354 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  53.93 
 
 
354 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  55.83 
 
 
352 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  54.19 
 
 
354 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  53.35 
 
 
355 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  54.29 
 
 
358 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  55.62 
 
 
361 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  55.15 
 
 
356 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  55.56 
 
 
353 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  52.63 
 
 
355 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  54.37 
 
 
349 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.74 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  55.01 
 
 
345 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  55.74 
 
 
355 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  52.47 
 
 
353 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  55.31 
 
 
357 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  53.95 
 
 
355 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.71 
 
 
349 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  52.94 
 
 
355 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.43 
 
 
349 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  53.93 
 
 
366 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.14 
 
 
349 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  53.66 
 
 
366 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  52.66 
 
 
353 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  53.31 
 
 
360 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  51.94 
 
 
360 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  54.31 
 
 
353 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  53.93 
 
 
352 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  54.31 
 
 
353 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  58.17 
 
 
357 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  53.95 
 
 
364 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  52.32 
 
 
365 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.82 
 
 
350 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.35 
 
 
354 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  52.88 
 
 
356 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  52.33 
 
 
352 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.87 
 
 
367 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  51.26 
 
 
351 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 
366 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  54.39 
 
 
350 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 
350 aa  364  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  53.58 
 
 
352 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.39 
 
 
365 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  54.89 
 
 
350 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.96 
 
 
379 aa  362  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  53.17 
 
 
364 aa  362  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 
363 aa  362  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.76 
 
 
364 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  53.2 
 
 
354 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  54.47 
 
 
364 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  51.1 
 
 
363 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.1 
 
 
357 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.1 
 
 
357 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  53.48 
 
 
364 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
357 aa  358  8e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  50.42 
 
 
371 aa  358  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  53.91 
 
 
363 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 
364 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.76 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  51.76 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.93 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  51.25 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  50.56 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.21 
 
 
365 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  53.8 
 
 
383 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  51.25 
 
 
360 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  58.54 
 
 
352 aa  355  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  53.89 
 
 
366 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.67 
 
 
365 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  50.7 
 
 
366 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 
362 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  52.14 
 
 
333 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  51 
 
 
359 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  53.06 
 
 
363 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 
363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.38 
 
 
332 aa  352  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.45 
 
 
369 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  51.79 
 
 
365 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.78 
 
 
372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.4 
 
 
365 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  51.32 
 
 
372 aa  352  7e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.14 
 
 
358 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5401  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.94 
 
 
366 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.91 
 
 
369 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  53.33 
 
 
357 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  51.57 
 
 
332 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  52.38 
 
 
359 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.7 
 
 
357 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>