More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4327 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  100 
 
 
355 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  83.1 
 
 
355 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  82.82 
 
 
355 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  70.25 
 
 
353 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  70 
 
 
358 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  70.34 
 
 
354 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  69.49 
 
 
354 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  68.36 
 
 
355 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  71.01 
 
 
345 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  68.64 
 
 
354 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  70.77 
 
 
364 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  70.49 
 
 
364 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  68.12 
 
 
353 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  64.97 
 
 
353 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  64.69 
 
 
353 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  63.46 
 
 
356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  67.24 
 
 
353 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  67.32 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  66.2 
 
 
357 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  65.54 
 
 
349 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  63.46 
 
 
352 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  63.28 
 
 
351 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  62.61 
 
 
352 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  61.43 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  63.84 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  63.56 
 
 
356 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  61.84 
 
 
360 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  62.71 
 
 
356 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  62.82 
 
 
356 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  62.32 
 
 
361 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  59.83 
 
 
355 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  63.43 
 
 
350 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  60.06 
 
 
355 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  58.03 
 
 
357 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  58.26 
 
 
356 aa  401  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  59.05 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  59.33 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  59.15 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  59.05 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  55.71 
 
 
364 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  57.54 
 
 
357 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.43 
 
 
364 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  56.74 
 
 
356 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 
364 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.94 
 
 
361 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.66 
 
 
361 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.1 
 
 
361 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.1 
 
 
361 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.38 
 
 
361 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.1 
 
 
361 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.94 
 
 
361 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3694  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.5 
 
 
360 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  53.95 
 
 
354 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.94 
 
 
360 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  55.4 
 
 
350 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  55.9 
 
 
354 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  53.13 
 
 
372 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.94 
 
 
360 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.94 
 
 
360 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  56.13 
 
 
367 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.94 
 
 
360 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  56.37 
 
 
352 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.02 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  54.67 
 
 
357 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  54.14 
 
 
366 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.11 
 
 
349 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 
363 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.11 
 
 
349 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  53.76 
 
 
365 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  55.22 
 
 
366 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  54.12 
 
 
364 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.7 
 
 
363 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.95 
 
 
369 aa  378  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.46 
 
 
349 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  52.63 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.97 
 
 
350 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 
357 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  52.47 
 
 
370 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.93 
 
 
368 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  54.75 
 
 
362 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 
362 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.09 
 
 
357 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.09 
 
 
357 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.86 
 
 
367 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  55.04 
 
 
384 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.86 
 
 
367 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  53.01 
 
 
364 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.76 
 
 
351 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.4 
 
 
350 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
369 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.68 
 
 
369 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  55.74 
 
 
360 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.81 
 
 
357 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 
358 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 
362 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  55.3 
 
 
352 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.18 
 
 
372 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  55.18 
 
 
355 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  54.8 
 
 
357 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  52.25 
 
 
365 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>