More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1257 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  100 
 
 
357 aa  724    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  67.04 
 
 
354 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  66.76 
 
 
354 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  67.04 
 
 
354 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  66.01 
 
 
355 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  64.44 
 
 
358 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  66.11 
 
 
353 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  66.2 
 
 
355 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  67.44 
 
 
345 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  61.8 
 
 
355 aa  454  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  64.51 
 
 
355 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  63.66 
 
 
353 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  64.23 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  62.82 
 
 
353 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  62.78 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  64.4 
 
 
364 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  64.95 
 
 
364 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  64.89 
 
 
354 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  62.54 
 
 
356 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  61.13 
 
 
355 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  61.06 
 
 
356 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  61.34 
 
 
356 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  61.69 
 
 
355 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  58.77 
 
 
364 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  61.17 
 
 
349 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.5 
 
 
364 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 
364 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  61.41 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  59.09 
 
 
352 aa  414  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  60 
 
 
352 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  60.78 
 
 
353 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  60.78 
 
 
353 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  59.55 
 
 
356 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  58.61 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  59.38 
 
 
350 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  58.07 
 
 
350 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  59.38 
 
 
351 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  58.38 
 
 
361 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  56.32 
 
 
357 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  54.34 
 
 
354 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.09 
 
 
350 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.57 
 
 
363 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.52 
 
 
350 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.44 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  54.9 
 
 
357 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  57.94 
 
 
354 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 
349 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  55.03 
 
 
362 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  55.18 
 
 
357 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.19 
 
 
351 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  55.31 
 
 
356 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  53.53 
 
 
365 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  53.61 
 
 
360 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  55.43 
 
 
356 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
364 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.49 
 
 
349 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  52.73 
 
 
363 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.77 
 
 
349 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
364 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  51.51 
 
 
364 aa  368  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.75 
 
 
363 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.97 
 
 
368 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
364 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.03 
 
 
395 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  53.37 
 
 
372 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.3 
 
 
379 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  52.89 
 
 
366 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.7 
 
 
372 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  56.46 
 
 
352 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
366 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  54.3 
 
 
379 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  53.57 
 
 
366 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  53.17 
 
 
366 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  51.09 
 
 
367 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
372 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
372 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.3 
 
 
372 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.24 
 
 
368 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  52.88 
 
 
364 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
372 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
372 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
372 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  55.34 
 
 
367 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 
370 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.46 
 
 
359 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  56.16 
 
 
352 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  53.46 
 
 
359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  53.93 
 
 
361 aa  362  8e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  52.51 
 
 
359 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.3 
 
 
367 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  52.91 
 
 
368 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  54.22 
 
 
360 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  53.95 
 
 
360 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  53.56 
 
 
358 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  53.28 
 
 
365 aa  359  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  53.95 
 
 
383 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  53.57 
 
 
359 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  53.64 
 
 
367 aa  359  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.94 
 
 
357 aa  358  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  51.79 
 
 
357 aa  358  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>