More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0238 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
363 aa  739    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  90.08 
 
 
363 aa  680    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99.17 
 
 
363 aa  733    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  72.8 
 
 
365 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  64.92 
 
 
364 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.62 
 
 
367 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.62 
 
 
367 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  54.95 
 
 
356 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  54.08 
 
 
366 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  54.52 
 
 
366 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  54.25 
 
 
366 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  53.59 
 
 
352 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  54.64 
 
 
354 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  54.25 
 
 
357 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56.4 
 
 
366 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  55.4 
 
 
353 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  53.95 
 
 
365 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  54.64 
 
 
355 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  56.04 
 
 
352 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  54.52 
 
 
356 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  53.44 
 
 
355 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  54.96 
 
 
366 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
364 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.13 
 
 
369 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  54.79 
 
 
364 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  54.25 
 
 
357 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  54.47 
 
 
352 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.89 
 
 
355 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  53.39 
 
 
358 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50.95 
 
 
367 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.91 
 
 
370 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.53 
 
 
372 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  53.62 
 
 
369 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  55.71 
 
 
361 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  52.88 
 
 
353 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  52.49 
 
 
355 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  53.57 
 
 
357 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  53.15 
 
 
353 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  52.75 
 
 
355 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  53.62 
 
 
369 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  52.96 
 
 
356 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  52.97 
 
 
356 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  53.19 
 
 
356 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  53.01 
 
 
354 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  52.38 
 
 
376 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.69 
 
 
369 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  53.02 
 
 
353 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  53.89 
 
 
364 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.42 
 
 
349 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  54.05 
 
 
370 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  55.07 
 
 
360 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  52.72 
 
 
354 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  51.1 
 
 
352 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  51.91 
 
 
364 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  51.52 
 
 
357 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  53.2 
 
 
353 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  51.78 
 
 
354 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  54.79 
 
 
360 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.7 
 
 
349 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.47 
 
 
359 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.72 
 
 
367 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  51.93 
 
 
359 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  51.65 
 
 
355 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50.68 
 
 
370 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  55.74 
 
 
362 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  50.28 
 
 
355 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.88 
 
 
362 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  52.47 
 
 
359 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.97 
 
 
349 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  52.68 
 
 
353 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.72 
 
 
367 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  51.37 
 
 
360 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  51.65 
 
 
360 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.92 
 
 
364 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 
360 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  51.09 
 
 
354 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  51.36 
 
 
360 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  51.65 
 
 
360 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1077  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
397 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.678355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  51.92 
 
 
364 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  51.65 
 
 
360 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0235  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
397 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 
360 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0350  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
397 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1654  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
397 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.04 
 
 
360 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  53.76 
 
 
384 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52.5 
 
 
402 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.01 
 
 
351 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  51.47 
 
 
374 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 
360 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.34 
 
 
370 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  51.36 
 
 
360 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.6 
 
 
362 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1236  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
397 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0069  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
397 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.65 
 
 
364 aa  364  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.14 
 
 
369 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.45 
 
 
366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>