More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1098 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  100 
 
 		 352 aa  714    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  60.85 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  60.56 
 
 		 356 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  61.41 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  61.56 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  61.19 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  60.45 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  62.25 
 
 		 353 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  60.56 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  61.41 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  60.77 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  60.28 
 
 		 354 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  59.38 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  59.38 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  60.39 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  58.1 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  58.4 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  59.94 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  60.17 
 
 		 345 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  59.94 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  60.34 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  59.15 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  57.91 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  59.31 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  58.43 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  57.88 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  56.3 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  59.42 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  57.38 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  57.91 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  55.74 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  56.29 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  57.63 
 
 		 353 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.04 
 
 		 363 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  58.87 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  55.49 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.77 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  56.46 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  57.72 
 
 		 364 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  56.7 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  56.02 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.22 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  55.12 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.83 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.82 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  55.31 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  54.87 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  55.49 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.21 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  53.67 
 
 		 354 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.49 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  54.31 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  55.04 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  55.62 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  54.42 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  54.13 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  53.13 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  53.31 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  54.24 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.59 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.59 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.22 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  53.13 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.6 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.6 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.41 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.49 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  54.12 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  52.12 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  54.72 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.88 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  54.72 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.98 
 
 		 351 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.77 
 
 		 349 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.7 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.55 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.73 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  54.73 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  52.46 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.19 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  53.87 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.62 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.19 
 
 		 356 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.26 
 
 		 332 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.5 
 
 		 367 aa  362  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.37 
 
 		 380 aa  362  8e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.69 
 
 		 381 aa  361  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  50.81 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  50.68 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.5 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.17 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.1 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  53.82 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  53.83 
 
 		 367 aa  360  3e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  54.08 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  53.22 
 
 		 362 aa  359  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  53.76 
 
 		 362 aa  359  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.63 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>