More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4666 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  94.66 
 
 
356 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  100 
 
 
356 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  63.94 
 
 
355 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  64.23 
 
 
354 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  62.82 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  62.71 
 
 
355 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  63.1 
 
 
354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  63.28 
 
 
353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  63.1 
 
 
354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  62.71 
 
 
355 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  62.36 
 
 
355 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  63.01 
 
 
345 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  61.84 
 
 
360 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  60.22 
 
 
355 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  60.85 
 
 
352 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  60.72 
 
 
358 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  61.06 
 
 
357 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  60.17 
 
 
361 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  61.13 
 
 
352 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  58.52 
 
 
356 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  58.71 
 
 
356 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  61.16 
 
 
354 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  60.45 
 
 
349 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  59.72 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  57.79 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  61.08 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  61.08 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  61.79 
 
 
364 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  58.71 
 
 
356 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  61.96 
 
 
364 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  59.5 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  60.11 
 
 
353 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  60.4 
 
 
350 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  57.83 
 
 
357 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  58.19 
 
 
355 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  58.59 
 
 
352 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  55.74 
 
 
356 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  56 
 
 
357 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  54.75 
 
 
368 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  55.24 
 
 
372 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  55.08 
 
 
354 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  56 
 
 
352 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.13 
 
 
350 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  57.18 
 
 
352 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  52.68 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  53.56 
 
 
350 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  54.29 
 
 
370 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.19 
 
 
364 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.02 
 
 
367 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.28 
 
 
369 aa  378  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  52.81 
 
 
353 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 
364 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.02 
 
 
367 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  53.46 
 
 
364 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.96 
 
 
363 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  54.84 
 
 
372 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.15 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
350 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  52.32 
 
 
363 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  53.76 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  52.35 
 
 
360 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  54.32 
 
 
362 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  53.76 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  53.76 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  52.19 
 
 
367 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.98 
 
 
369 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.13 
 
 
361 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  52.79 
 
 
362 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.76 
 
 
372 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.81 
 
 
351 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  52.97 
 
 
371 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  52.97 
 
 
371 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  54.27 
 
 
370 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.69 
 
 
369 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.56 
 
 
372 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 
372 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  52.29 
 
 
379 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.56 
 
 
379 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.26 
 
 
381 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  55.46 
 
 
352 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  53.99 
 
 
370 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  51.83 
 
 
368 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 
372 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 
372 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 
372 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 
372 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.49 
 
 
372 aa  368  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  52.11 
 
 
368 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.44 
 
 
349 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.28 
 
 
369 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.07 
 
 
349 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  60.32 
 
 
357 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  51.66 
 
 
366 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  51.08 
 
 
371 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.38 
 
 
362 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  50.41 
 
 
370 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.15 
 
 
363 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  53.46 
 
 
351 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.49 
 
 
365 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
349 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>