More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1688 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  100 
 
 
357 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  92.44 
 
 
357 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  74.79 
 
 
356 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  66.76 
 
 
356 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  58.69 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  58.54 
 
 
355 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  57.83 
 
 
356 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  57.63 
 
 
354 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  57.14 
 
 
354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  58.1 
 
 
355 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  54.74 
 
 
366 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.22 
 
 
366 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  55.74 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  56.86 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  56.3 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  55.93 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  57.7 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  56.86 
 
 
353 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  57.83 
 
 
361 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  58.29 
 
 
356 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  57.54 
 
 
355 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  59.54 
 
 
353 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  56.34 
 
 
356 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  57.26 
 
 
364 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  56.3 
 
 
352 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  57.55 
 
 
349 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  57.66 
 
 
354 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 
363 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  56.02 
 
 
355 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  56.3 
 
 
355 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  58.97 
 
 
353 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  57.63 
 
 
352 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  56.3 
 
 
353 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  56.51 
 
 
355 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  55.62 
 
 
363 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.18 
 
 
349 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  54.72 
 
 
354 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  54.57 
 
 
359 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  55.52 
 
 
358 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  53.85 
 
 
360 aa  381  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.06 
 
 
349 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  56.3 
 
 
364 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.51 
 
 
349 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
363 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  55.62 
 
 
345 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  53.37 
 
 
365 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  53.65 
 
 
365 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  54.4 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  55.18 
 
 
357 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.4 
 
 
360 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.66 
 
 
363 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.6 
 
 
365 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  57.43 
 
 
352 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.17 
 
 
362 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.68 
 
 
351 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  52.34 
 
 
366 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  54.82 
 
 
368 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.24 
 
 
365 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  53.56 
 
 
357 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.24 
 
 
369 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  52.08 
 
 
372 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.97 
 
 
367 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 
358 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 
361 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  54.29 
 
 
368 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  54.74 
 
 
364 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 
362 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  63.48 
 
 
357 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.32 
 
 
356 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.8 
 
 
365 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  62.8 
 
 
360 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.39 
 
 
359 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  55.72 
 
 
372 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  62.8 
 
 
360 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  51.98 
 
 
353 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.39 
 
 
365 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.04 
 
 
356 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.44 
 
 
361 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  53.35 
 
 
350 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.86 
 
 
369 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  54.8 
 
 
369 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.44 
 
 
361 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  53.57 
 
 
367 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  54.24 
 
 
350 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.04 
 
 
356 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  52.53 
 
 
359 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.11 
 
 
332 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  62.8 
 
 
360 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 
357 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  56.25 
 
 
366 aa  364  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.04 
 
 
356 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  51.39 
 
 
359 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  52.2 
 
 
356 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 
368 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.41 
 
 
361 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.72 
 
 
361 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  56.07 
 
 
368 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
369 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  52.71 
 
 
332 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.76 
 
 
356 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>