More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0283 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  100 
 
 
353 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  94.05 
 
 
353 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  75.14 
 
 
354 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  67.23 
 
 
354 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  67.51 
 
 
355 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  66.67 
 
 
354 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  67.42 
 
 
354 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  66.38 
 
 
353 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  64.69 
 
 
355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  66.01 
 
 
352 aa  464  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  64.9 
 
 
358 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  64.69 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  64.12 
 
 
355 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  65.99 
 
 
345 aa  447  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  62.99 
 
 
349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  64.96 
 
 
350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  62.82 
 
 
357 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  63.49 
 
 
364 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  61.86 
 
 
355 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  63.76 
 
 
364 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  62.15 
 
 
356 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  61.58 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  61.76 
 
 
361 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  61.69 
 
 
355 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  63.19 
 
 
353 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  61.13 
 
 
355 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  63.77 
 
 
353 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  60.45 
 
 
351 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  61.11 
 
 
360 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  60.96 
 
 
356 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  60.11 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.82 
 
 
360 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  56.63 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  54.39 
 
 
354 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  57.83 
 
 
352 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  57.67 
 
 
350 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  56.55 
 
 
364 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  57.87 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  56.3 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  56.86 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.55 
 
 
364 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 
364 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  56.46 
 
 
356 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  54.3 
 
 
364 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.58 
 
 
350 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  57.63 
 
 
352 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.02 
 
 
351 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
350 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  53.44 
 
 
366 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 
366 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 
363 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  52.97 
 
 
372 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  53.72 
 
 
366 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  52.47 
 
 
356 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  51.78 
 
 
363 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  54.4 
 
 
360 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  56.3 
 
 
357 aa  374  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  54.19 
 
 
362 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.07 
 
 
356 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  53.17 
 
 
366 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  51.8 
 
 
364 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  52.17 
 
 
369 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  53.2 
 
 
374 aa  371  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  51.52 
 
 
364 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  54.24 
 
 
369 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  51.8 
 
 
364 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.95 
 
 
368 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  52.79 
 
 
356 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
357 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
364 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  50.96 
 
 
364 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.12 
 
 
361 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.65 
 
 
358 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  53.85 
 
 
352 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 
369 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.35 
 
 
361 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
363 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  52.79 
 
 
356 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  55.06 
 
 
368 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  53.65 
 
 
368 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.78 
 
 
349 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  52.51 
 
 
356 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 
386 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.65 
 
 
359 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  54.5 
 
 
360 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 
363 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  53.58 
 
 
359 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  51.23 
 
 
369 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 
356 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.35 
 
 
362 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>