More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4521 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  100 
 
 
352 aa  715    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  61.43 
 
 
355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  62.29 
 
 
353 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  61.36 
 
 
354 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  60.97 
 
 
354 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  60.68 
 
 
355 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  60.97 
 
 
354 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  61.67 
 
 
364 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  60.29 
 
 
349 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  60 
 
 
358 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  61.4 
 
 
345 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  61.39 
 
 
364 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  59.71 
 
 
355 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  58.86 
 
 
355 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  58.29 
 
 
352 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  60.51 
 
 
354 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  58.17 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  59.09 
 
 
357 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  59.94 
 
 
352 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  60.29 
 
 
361 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  58.97 
 
 
353 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  58.84 
 
 
353 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  59.27 
 
 
360 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  56.53 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  57.83 
 
 
353 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  58.26 
 
 
353 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  56.32 
 
 
351 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  58.5 
 
 
350 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  57.26 
 
 
355 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  56.57 
 
 
356 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 
363 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  56 
 
 
356 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  54.83 
 
 
356 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  54.39 
 
 
355 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  54.32 
 
 
363 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 
363 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  55.62 
 
 
352 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.32 
 
 
372 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  54.79 
 
 
384 aa  371  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  55.62 
 
 
356 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  55.14 
 
 
350 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.83 
 
 
369 aa  368  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.03 
 
 
395 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  53.98 
 
 
360 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.43 
 
 
350 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.14 
 
 
350 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50 
 
 
367 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.51 
 
 
358 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.26 
 
 
358 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  53.67 
 
 
354 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  54.78 
 
 
364 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  52.34 
 
 
368 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  54.42 
 
 
402 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  54.47 
 
 
369 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.84 
 
 
357 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.78 
 
 
364 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  50.69 
 
 
365 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  54.04 
 
 
375 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.49 
 
 
364 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  54.34 
 
 
357 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  52.89 
 
 
369 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  54.6 
 
 
357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  54.49 
 
 
585 aa  362  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  52.73 
 
 
366 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  55.28 
 
 
366 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.62 
 
 
359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50 
 
 
367 aa  361  8e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  53.28 
 
 
366 aa  361  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50 
 
 
367 aa  361  8e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.72 
 
 
369 aa  361  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  52.35 
 
 
365 aa  360  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  51.97 
 
 
356 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  54.19 
 
 
369 aa  361  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  51.97 
 
 
356 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.37 
 
 
369 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  54.39 
 
 
369 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.97 
 
 
356 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.69 
 
 
356 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.38 
 
 
367 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.97 
 
 
356 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.97 
 
 
356 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  55.46 
 
 
357 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  55.62 
 
 
359 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.12 
 
 
356 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  55.46 
 
 
352 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  53.24 
 
 
372 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  55.75 
 
 
352 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  52.34 
 
 
369 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  53.19 
 
 
370 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  54.42 
 
 
366 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.97 
 
 
356 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.69 
 
 
356 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.97 
 
 
356 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.69 
 
 
356 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  51.52 
 
 
366 aa  359  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  53.22 
 
 
360 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5401  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.67 
 
 
366 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.24 
 
 
368 aa  359  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.69 
 
 
356 aa  359  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>