More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6524 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  100 
 
 
366 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  74.45 
 
 
365 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.43 
 
 
366 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  61.16 
 
 
366 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  60.88 
 
 
366 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  53.53 
 
 
367 aa  401  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  55.04 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  54.47 
 
 
365 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.41 
 
 
367 aa  388  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.41 
 
 
367 aa  388  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 
363 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.13 
 
 
367 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  52.85 
 
 
367 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  55.49 
 
 
360 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.75 
 
 
370 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  54.1 
 
 
357 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.5 
 
 
359 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  54.92 
 
 
355 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.59 
 
 
367 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.16 
 
 
363 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  55.22 
 
 
355 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 
363 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  54.5 
 
 
359 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52 
 
 
372 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  52.3 
 
 
369 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  53.8 
 
 
370 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  52.99 
 
 
370 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.23 
 
 
368 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  50.66 
 
 
371 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  52.34 
 
 
357 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  53.7 
 
 
352 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  54.82 
 
 
355 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  52.8 
 
 
363 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.29 
 
 
374 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.93 
 
 
371 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  53.7 
 
 
354 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  54.03 
 
 
372 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  53.7 
 
 
354 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 
369 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  54.82 
 
 
353 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  54.47 
 
 
358 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  50.53 
 
 
371 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.74 
 
 
384 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  50.54 
 
 
386 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.53 
 
 
372 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  52.53 
 
 
372 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  52.17 
 
 
366 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  53.42 
 
 
354 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  54.44 
 
 
356 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  54.27 
 
 
356 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  50.68 
 
 
366 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  53.57 
 
 
355 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  52.17 
 
 
366 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.27 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
364 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  50 
 
 
379 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.53 
 
 
379 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.14 
 
 
370 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  50.8 
 
 
372 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  50.27 
 
 
371 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  50.8 
 
 
372 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  50.27 
 
 
371 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  55.77 
 
 
345 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  50.8 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  50.8 
 
 
372 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  53.44 
 
 
353 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.02 
 
 
370 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  52.02 
 
 
370 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 
372 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 
372 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.34 
 
 
365 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.74 
 
 
377 aa  364  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  54.9 
 
 
349 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  53.57 
 
 
357 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.6 
 
 
360 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  50.81 
 
 
384 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  50.81 
 
 
384 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  55.21 
 
 
353 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  53.44 
 
 
353 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  53.02 
 
 
355 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  50.27 
 
 
384 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  52.47 
 
 
354 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.9 
 
 
426 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.7 
 
 
352 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  50.27 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  51.77 
 
 
364 aa  362  6e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  51.79 
 
 
356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  55.28 
 
 
352 aa  362  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  51.77 
 
 
364 aa  362  8e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  52.75 
 
 
357 aa  361  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.04 
 
 
360 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  51.79 
 
 
362 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  52.83 
 
 
369 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  54.65 
 
 
353 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.04 
 
 
360 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
364 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.47 
 
 
349 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>