More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0843 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  95.7 
 
 		 372 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  89.25 
 
 		 372 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  89.25 
 
 		 379 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  87.33 
 
 		 371 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  95.7 
 
 		 372 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  89.52 
 
 		 379 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  100 
 
 		 371 aa  754    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  87.1 
 
 		 371 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  95.7 
 
 		 372 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.25 
 
 		 372 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  100 
 
 		 371 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  95.7 
 
 		 372 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.25 
 
 		 372 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.25 
 
 		 372 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  92.2 
 
 		 372 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.52 
 
 		 372 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.52 
 
 		 372 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  87.1 
 
 		 371 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  62.73 
 
 		 367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  59.95 
 
 		 386 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 		 386 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  57.91 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  57.95 
 
 		 389 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  60.7 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  58.22 
 
 		 384 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  57.95 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  58.06 
 
 		 381 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.53 
 
 		 386 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  58.22 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  59.15 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  58.4 
 
 		 371 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  57.95 
 
 		 384 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  58.56 
 
 		 371 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  57.98 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  55.76 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  57.71 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  55.88 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  54.57 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  55.53 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  55.76 
 
 		 365 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  55.26 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  55.79 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  51.08 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  55.88 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.33 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  51.34 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.26 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  51.34 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  49.87 
 
 		 376 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.66 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  50.54 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  53.24 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  53.64 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.47 
 
 		 370 aa  371  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50 
 
 		 368 aa  371  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  52.97 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.81 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  53.24 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.11 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.41 
 
 		 370 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  50.27 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  52.28 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.07 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.16 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.53 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  51.48 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  52.69 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  49.47 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.53 
 
 		 372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  51.34 
 
 		 352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  47.09 
 
 		 405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  48.09 
 
 		 365 aa  362  8e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.48 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  51.36 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.11 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  51.75 
 
 		 360 aa  360  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  50.53 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  52.3 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  51.08 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.27 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  50.13 
 
 		 380 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  52.97 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.31 
 
 		 366 aa  359  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  50.4 
 
 		 373 aa  358  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  51.08 
 
 		 349 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.13 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>