More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3576 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  100 
 
 		 373 aa  749    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  54.93 
 
 		 370 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  54.28 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  54.13 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  53.87 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  53.87 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  54.01 
 
 		 371 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.48 
 
 		 354 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  53.48 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  52.52 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  53.46 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  51.2 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  52.42 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  50.27 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  51.87 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  50.67 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  51.72 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  51.33 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  51.87 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  51.73 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  51.6 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  50.54 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  50.67 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.27 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  52.67 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  53.53 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  52.13 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.8 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  51.87 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  50.92 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.67 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  50.53 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  50.53 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.66 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  50.27 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  52.65 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  50.27 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  50.27 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  51.86 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  49.73 
 
 		 363 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  49.73 
 
 		 363 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  51.06 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.98 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  51.33 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  45.93 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.38 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.65 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  47.58 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.77 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  46.26 
 
 		 366 aa  345  7e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  47.31 
 
 		 356 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  49.46 
 
 		 355 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  50.94 
 
 		 357 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  49.33 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  51.09 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  47.04 
 
 		 353 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  48.26 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 380 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  45.97 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  48.26 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  46.24 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.18 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  45.84 
 
 		 355 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  47.31 
 
 		 353 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.58 
 
 		 355 aa  338  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.7 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  51.06 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  45.04 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  45.04 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  46.34 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  45.97 
 
 		 351 aa  335  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.24 
 
 		 364 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  49.85 
 
 		 359 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  46.26 
 
 		 370 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  47.06 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  46.65 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  45.16 
 
 		 381 aa  333  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  46.9 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  46.38 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  46.51 
 
 		 367 aa  332  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  46.51 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.14 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  47.58 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  49.11 
 
 		 359 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  49.55 
 
 		 354 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.17 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  45.16 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  49.25 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  44.95 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  46.2 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50.29 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  50.3 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>