More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3126 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  93.52 
 
 
357 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  74.72 
 
 
360 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  57.26 
 
 
355 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  53.87 
 
 
389 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  53.95 
 
 
365 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  55.07 
 
 
370 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  53.51 
 
 
386 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  54.42 
 
 
386 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  54.74 
 
 
371 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  54.77 
 
 
371 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  54.47 
 
 
371 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  53.83 
 
 
369 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  54.82 
 
 
371 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  54.14 
 
 
384 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 
363 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.23 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  52.96 
 
 
379 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.55 
 
 
367 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  53.59 
 
 
384 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.23 
 
 
379 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  54.67 
 
 
371 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  54.14 
 
 
384 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  54.47 
 
 
376 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.5 
 
 
367 aa  368  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
372 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
372 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  51.63 
 
 
371 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.55 
 
 
367 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.45 
 
 
369 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  53.31 
 
 
384 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 
386 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  53.12 
 
 
371 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  54.67 
 
 
381 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.46 
 
 
386 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  51.37 
 
 
367 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  51.61 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  50.28 
 
 
363 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  51.36 
 
 
371 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  51.36 
 
 
371 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.1 
 
 
363 aa  359  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.36 
 
 
371 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  51.22 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.68 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.86 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  51.27 
 
 
352 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.43 
 
 
369 aa  355  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  52.2 
 
 
365 aa  355  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  49.59 
 
 
365 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  52.96 
 
 
356 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  51.51 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  51.51 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  51.51 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.76 
 
 
368 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  52.25 
 
 
354 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  51.27 
 
 
355 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  52.22 
 
 
357 aa  348  8e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.77 
 
 
364 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  50.7 
 
 
353 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  51.39 
 
 
354 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  51.56 
 
 
353 aa  346  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.4 
 
 
354 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  49.72 
 
 
367 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  50.85 
 
 
356 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  50.28 
 
 
352 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  51.56 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  48.22 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  47.51 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  50.42 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  50.41 
 
 
356 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.08 
 
 
370 aa  342  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.55 
 
 
358 aa  342  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  49.43 
 
 
356 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  49.45 
 
 
367 aa  341  9e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  46.76 
 
 
374 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.42 
 
 
355 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  54.08 
 
 
372 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  49.15 
 
 
355 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  50.67 
 
 
373 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  50.28 
 
 
360 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.14 
 
 
366 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  50.99 
 
 
355 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
366 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  50.7 
 
 
356 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.3 
 
 
349 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  51.56 
 
 
360 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  50 
 
 
363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  50 
 
 
360 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  338  7e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  50 
 
 
363 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
370 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  48.77 
 
 
366 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  49.72 
 
 
361 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.73 
 
 
369 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  52.3 
 
 
353 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>