More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1094 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  100 
 
 		 356 aa  721    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  84.83 
 
 		 357 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  54.99 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  52.55 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  52.41 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  52 
 
 		 371 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  52.14 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  54.01 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  52.14 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  51.92 
 
 		 360 aa  355  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.77 
 
 		 379 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  51.48 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  56.77 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  53.3 
 
 		 376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.77 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.77 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.77 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.77 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  52.04 
 
 		 389 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.77 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.77 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  50.98 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  56.36 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  56.36 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  53.19 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  55.83 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  55.83 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  55.83 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  58.31 
 
 		 372 aa  348  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  57.02 
 
 		 371 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  51.49 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.23 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  50.14 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  51.91 
 
 		 384 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  51.5 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  52.19 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  51.94 
 
 		 357 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  51.77 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  52.32 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  50.82 
 
 		 386 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  52.05 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  55.94 
 
 		 371 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  50.7 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  51.92 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  49.18 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  50.41 
 
 		 359 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.98 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.37 
 
 		 386 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  52.04 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  52.02 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  51.1 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.47 
 
 		 354 aa  339  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.84 
 
 		 355 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  58.1 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.14 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  51.61 
 
 		 364 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.48 
 
 		 385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  50.67 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.73 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  50.56 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  51.53 
 
 		 353 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  50.42 
 
 		 351 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  57.55 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  53.61 
 
 		 358 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  50.7 
 
 		 354 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  51.09 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  49.3 
 
 		 354 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  50 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  50.14 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  49.58 
 
 		 352 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.75 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  51.11 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  54.87 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  48.21 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  51.14 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  49.3 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  51.92 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  50.56 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  49.72 
 
 		 356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  50.14 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.55 
 
 		 360 aa  325  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  49.17 
 
 		 356 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  51.14 
 
 		 368 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  48.75 
 
 		 379 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  49.02 
 
 		 355 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.86 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.27 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  50.82 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  49.59 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  49.86 
 
 		 354 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  49.54 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  50.61 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  48.87 
 
 		 349 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  49.86 
 
 		 353 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>