More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4552 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  100 
 
 		 360 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  74.72 
 
 		 357 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  74.72 
 
 		 359 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  57.22 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  54.77 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  54.7 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  55.74 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  55.74 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  54.69 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  54.96 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  52.43 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  55.23 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.01 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  52.04 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  53.37 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  53.48 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  52.04 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  51.93 
 
 		 367 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  53.8 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  51.23 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  52.94 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  53.35 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  51.63 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  52.21 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  53.26 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  54.32 
 
 		 357 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  55.25 
 
 		 365 aa  361  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  53.49 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  51.27 
 
 		 352 aa  358  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  52.3 
 
 		 372 aa  358  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.57 
 
 		 379 aa  358  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.76 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.57 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  52.3 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.68 
 
 		 368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  51.92 
 
 		 356 aa  355  5e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  51.76 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  51.76 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  51.76 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.35 
 
 		 369 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  51.8 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.8 
 
 		 369 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  51.96 
 
 		 352 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  52.17 
 
 		 354 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  51.68 
 
 		 353 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  51.09 
 
 		 371 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  51.09 
 
 		 371 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  50.82 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  49.32 
 
 		 363 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  52.1 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.78 
 
 		 354 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.27 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  52.09 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.91 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.91 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  49.31 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 363 aa  345  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  49.31 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  51.08 
 
 		 368 aa  345  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.12 
 
 		 370 aa  344  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  52.92 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  50.57 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.85 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.23 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  50.68 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  50.93 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  49.45 
 
 		 359 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.81 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  51.66 
 
 		 354 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  49.86 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.41 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  49.31 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  49.17 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.18 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.14 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  49.58 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  50.99 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  51.58 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.55 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  48.63 
 
 		 356 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  50.13 
 
 		 364 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  49.58 
 
 		 355 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  49.31 
 
 		 356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  49.04 
 
 		 364 aa  338  7e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  50.14 
 
 		 353 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  46.77 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  49.72 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  48.9 
 
 		 366 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  48.61 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.27 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.43 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>