More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1692 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 355 aa  723    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  57.1 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  57.91 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.64 
 
 		 379 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.64 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.64 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.64 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.64 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.64 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.64 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  56.27 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.8 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  56.01 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  56.99 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  56.98 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  56.99 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  56.99 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  57.89 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  55.88 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  57.26 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  57.22 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  54.57 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  55.88 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  56.28 
 
 		 389 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  55.08 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  54.96 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  55.56 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  55.31 
 
 		 384 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  55.56 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.74 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  55.85 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  54.78 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  54.3 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  54.84 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  54.74 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  55.62 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  55.26 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  56.67 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  54.99 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  55.28 
 
 		 384 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  53.48 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  54.42 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  54.79 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.52 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  54.44 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  55.18 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  53.95 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  54.85 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  53.08 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  53.8 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  53.33 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  53.52 
 
 		 354 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  53.8 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  52.94 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.1 
 
 		 368 aa  358  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  54.32 
 
 		 357 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  52.12 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.51 
 
 		 355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  50.79 
 
 		 373 aa  355  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  54.42 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  52.11 
 
 		 353 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  53.12 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  52.53 
 
 		 355 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  51.56 
 
 		 349 aa  352  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  54.79 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.41 
 
 		 367 aa  349  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  53.68 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  50.56 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  52.22 
 
 		 356 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  52.22 
 
 		 356 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  54.52 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  50.84 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  48.61 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.55 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  50.42 
 
 		 352 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.26 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  51.69 
 
 		 352 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.52 
 
 		 380 aa  345  7e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.97 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.59 
 
 		 362 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  52.12 
 
 		 351 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  50.69 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.27 
 
 		 353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.75 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  48.63 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.96 
 
 		 367 aa  342  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 		 349 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.63 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  51.14 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  52.23 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.41 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  49.58 
 
 		 381 aa  339  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  51.25 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  51.43 
 
 		 353 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>