More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3783 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  100 
 
 
371 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  98.92 
 
 
371 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  95.14 
 
 
371 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  95.41 
 
 
371 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  79.78 
 
 
370 aa  610  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  78.11 
 
 
371 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  74.05 
 
 
354 aa  551  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  59.84 
 
 
371 aa  464  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  58.18 
 
 
368 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  58.13 
 
 
372 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  56.6 
 
 
365 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  56.68 
 
 
372 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  56.95 
 
 
372 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  56.95 
 
 
372 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  56.95 
 
 
372 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  57.98 
 
 
371 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.23 
 
 
371 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  56.68 
 
 
371 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  57.98 
 
 
371 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  55.14 
 
 
367 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  54.3 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  55.03 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  56.12 
 
 
372 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  53.19 
 
 
376 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  55.08 
 
 
379 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.35 
 
 
379 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.35 
 
 
372 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.35 
 
 
372 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.08 
 
 
372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  53.87 
 
 
373 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  54.96 
 
 
355 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  54.67 
 
 
357 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  51.59 
 
 
363 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 
386 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  54.69 
 
 
360 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.13 
 
 
368 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 
386 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  52.01 
 
 
389 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.44 
 
 
386 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  51.59 
 
 
363 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  54.67 
 
 
359 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  52.28 
 
 
386 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  53.08 
 
 
357 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.85 
 
 
369 aa  366  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  52.83 
 
 
356 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  50.93 
 
 
365 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.54 
 
 
367 aa  364  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  51.7 
 
 
381 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.54 
 
 
367 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  51.32 
 
 
384 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  51.87 
 
 
384 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.47 
 
 
356 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  51.87 
 
 
384 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  52.14 
 
 
356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  50.79 
 
 
384 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.39 
 
 
369 aa  355  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  50.81 
 
 
354 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  351  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  51 
 
 
367 aa  351  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.08 
 
 
354 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  51 
 
 
367 aa  351  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  47.63 
 
 
367 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 
345 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  50.54 
 
 
354 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  49.59 
 
 
366 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  49.6 
 
 
355 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.35 
 
 
370 aa  344  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  48.76 
 
 
352 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  50.54 
 
 
357 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.4 
 
 
370 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  48.53 
 
 
355 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.31 
 
 
356 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  49.05 
 
 
352 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.02 
 
 
366 aa  341  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.25 
 
 
365 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  47.71 
 
 
355 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  48.38 
 
 
353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.01 
 
 
370 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  49.46 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
406 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  49.73 
 
 
358 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  47.88 
 
 
365 aa  339  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.58 
 
 
372 aa  339  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  46.54 
 
 
349 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
364 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.44 
 
 
369 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  47.62 
 
 
379 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  46.11 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  49.73 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  49.06 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  47.85 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  48.12 
 
 
354 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.06 
 
 
370 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  47.97 
 
 
365 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.47 
 
 
366 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  48.55 
 
 
364 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>