More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4690 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  95.75 
 
 
353 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  100 
 
 
353 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  67.43 
 
 
358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  67.24 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  66.38 
 
 
355 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  66.76 
 
 
355 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  65.82 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  65.81 
 
 
355 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  65.81 
 
 
353 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  65.14 
 
 
349 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  64.2 
 
 
354 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  66.67 
 
 
352 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  65.03 
 
 
354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  65.65 
 
 
364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  65.22 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  64.45 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  65.1 
 
 
364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  64.51 
 
 
356 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  64.08 
 
 
361 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  62.87 
 
 
351 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  63.77 
 
 
353 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  62.82 
 
 
355 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  63.48 
 
 
353 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  62.14 
 
 
355 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  61.36 
 
 
356 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  61.08 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  63.04 
 
 
354 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  61.02 
 
 
360 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  60.78 
 
 
357 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  61.27 
 
 
355 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  61.7 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  58.26 
 
 
352 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  59.31 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  59.54 
 
 
357 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  59.31 
 
 
352 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  59.77 
 
 
356 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  58.12 
 
 
357 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  55.49 
 
 
369 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  56.03 
 
 
350 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.7 
 
 
360 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  56.9 
 
 
352 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.66 
 
 
361 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  53.57 
 
 
366 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  56.62 
 
 
354 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  56.75 
 
 
367 aa  371  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  56.75 
 
 
367 aa  371  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.17 
 
 
372 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
363 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.97 
 
 
350 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  54.62 
 
 
357 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.13 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.66 
 
 
361 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.66 
 
 
361 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  54.31 
 
 
356 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.37 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.66 
 
 
361 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.37 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.99 
 
 
361 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  53.26 
 
 
364 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.62 
 
 
351 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 
364 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3694  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.97 
 
 
360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.13 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.26 
 
 
364 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.4 
 
 
360 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  54.47 
 
 
366 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  55.4 
 
 
360 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  55.68 
 
 
360 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  54.47 
 
 
366 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  56.9 
 
 
352 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 
369 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  53.33 
 
 
369 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.4 
 
 
360 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.4 
 
 
360 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  53.95 
 
 
370 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.4 
 
 
360 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.22 
 
 
351 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
350 aa  364  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  54.29 
 
 
385 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 
366 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  55.21 
 
 
366 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.43 
 
 
349 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  54.13 
 
 
354 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  50.41 
 
 
370 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  52.08 
 
 
367 aa  361  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  51.55 
 
 
363 aa  361  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  52.08 
 
 
367 aa  361  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  54.19 
 
 
367 aa  360  1e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.83 
 
 
363 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.33 
 
 
366 aa  359  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  53.02 
 
 
367 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 
349 aa  359  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  54.97 
 
 
362 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  53.63 
 
 
367 aa  359  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  53.99 
 
 
371 aa  359  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  52.33 
 
 
366 aa  358  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.67 
 
 
349 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.22 
 
 
360 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.94 
 
 
351 aa  358  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.33 
 
 
366 aa  358  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>