More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2334 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  100 
 
 
363 aa  742    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  98.33 
 
 
368 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  82.64 
 
 
363 aa  608  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  79.22 
 
 
361 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  71.19 
 
 
356 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  62.4 
 
 
357 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  57.82 
 
 
360 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  56.27 
 
 
357 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  56.94 
 
 
361 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4571  ABC transporter related  58.13 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0013207  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.1 
 
 
359 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  54.11 
 
 
365 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.76 
 
 
378 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  53.48 
 
 
393 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  52.37 
 
 
365 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  52.3 
 
 
371 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  50.95 
 
 
369 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.7 
 
 
372 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  52.83 
 
 
372 aa  362  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  52.97 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  52.97 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  52.97 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  49.87 
 
 
376 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  52.3 
 
 
371 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  52.3 
 
 
371 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.56 
 
 
369 aa  360  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  51.89 
 
 
372 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  52.3 
 
 
371 aa  358  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.73 
 
 
384 aa  357  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.03 
 
 
371 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.35 
 
 
379 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.62 
 
 
372 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.62 
 
 
372 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.62 
 
 
372 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.38 
 
 
369 aa  351  8.999999999999999e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.62 
 
 
372 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.62 
 
 
372 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.62 
 
 
372 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  51.35 
 
 
379 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.73 
 
 
368 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.5 
 
 
367 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  49.72 
 
 
353 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.84 
 
 
369 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  50.98 
 
 
364 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
386 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.27 
 
 
372 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  49.32 
 
 
389 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  48.77 
 
 
371 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  49.17 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  50.82 
 
 
363 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.8 
 
 
386 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  48.89 
 
 
356 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.47 
 
 
370 aa  342  8e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  48.12 
 
 
384 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
364 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  50.58 
 
 
361 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  49.44 
 
 
353 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  48.12 
 
 
384 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 
386 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  50.54 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  49.72 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  50.68 
 
 
357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  51.3 
 
 
366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  50.28 
 
 
360 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  49.04 
 
 
384 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  47.58 
 
 
384 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  47.67 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  48.76 
 
 
381 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.45 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  49.58 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  48.33 
 
 
363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  49.32 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  49.56 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  48.34 
 
 
376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  47.83 
 
 
367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  49.56 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.64 
 
 
372 aa  335  7e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2694  ABC transporter related  48.47 
 
 
354 aa  335  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.61 
 
 
361 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 
360 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  46.76 
 
 
372 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 
360 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  46.2 
 
 
370 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  48.77 
 
 
369 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  47.15 
 
 
371 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.35 
 
 
371 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  47.88 
 
 
359 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.35 
 
 
367 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  50 
 
 
361 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.35 
 
 
367 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 
360 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  48.88 
 
 
360 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.36 
 
 
369 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  48.77 
 
 
369 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.02 
 
 
352 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.19 
 
 
365 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.33 
 
 
361 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.33 
 
 
361 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 
360 aa  332  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  47.59 
 
 
359 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>