More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5438 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  100 
 
 		 365 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  83.52 
 
 		 378 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  83.06 
 
 		 393 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  64.53 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  64.23 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  56.42 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  54.11 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  54.44 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4571  ABC transporter related  56.63 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  55.12 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.49 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  52.56 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.95 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  48.47 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  50.43 
 
 		 365 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.1 
 
 		 365 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  47.06 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  49.17 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  48.63 
 
 		 376 aa  335  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  47.97 
 
 		 371 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  48.62 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  48.75 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  50.7 
 
 		 356 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  50.68 
 
 		 372 aa  332  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  47.86 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  48.33 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  48.07 
 
 		 371 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  48.07 
 
 		 371 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  47.8 
 
 		 354 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  48.31 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  47.03 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.51 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  48.89 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  48.19 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  48.18 
 
 		 353 aa  325  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 363 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  48.32 
 
 		 352 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  47.68 
 
 		 371 aa  325  9e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  50 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  46.34 
 
 		 371 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  47.46 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  49.03 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  50 
 
 		 384 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  49.31 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  49.57 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.17 
 
 		 367 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  47.12 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  49.45 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  48.7 
 
 		 357 aa  322  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  47.63 
 
 		 351 aa  322  7e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  45.01 
 
 		 389 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  48.34 
 
 		 353 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  48.46 
 
 		 364 aa  322  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  47.49 
 
 		 355 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  48.09 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  48.16 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  46.13 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  46.11 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  49.44 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  47.54 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  47.91 
 
 		 368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  46.81 
 
 		 372 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  47.89 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  49.72 
 
 		 352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  48.32 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  47.35 
 
 		 354 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  45.41 
 
 		 386 aa  318  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  47.24 
 
 		 354 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 374 aa  318  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.22 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.29 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.31 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  45.71 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  46.4 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  46.41 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.17 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  48.49 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.31 
 
 		 369 aa  316  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  47.9 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  46.13 
 
 		 351 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  47.35 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  46.41 
 
 		 355 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  46.63 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 		 372 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.67 
 
 		 379 aa  315  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  47.47 
 
 		 355 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.83 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  47.2 
 
 		 372 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  46.88 
 
 		 371 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  46.88 
 
 		 371 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  48.59 
 
 		 352 aa  315  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  47.55 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  48.88 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.14 
 
 		 368 aa  315  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>