More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1111 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  100 
 
 		 345 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  79.14 
 
 		 352 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  73.39 
 
 		 350 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  65.64 
 
 		 358 aa  434  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  57.18 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  57.89 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  58.19 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  56.89 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  56.23 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  55.81 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  53.59 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  56.65 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  55.12 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.07 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  55.12 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  55.4 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  54.52 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  54.67 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  54.6 
 
 		 378 aa  364  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.78 
 
 		 333 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  54.29 
 
 		 362 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  55.22 
 
 		 362 aa  361  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  59.93 
 
 		 334 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.37 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  59.55 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  54.78 
 
 		 341 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  54.42 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  55.1 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.14 
 
 		 373 aa  359  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  54.06 
 
 		 368 aa  359  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  54.49 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  54.49 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  50 
 
 		 381 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  55.33 
 
 		 336 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.68 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  53.78 
 
 		 332 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  55.01 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  54.75 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  55.33 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.63 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  55.65 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  57.71 
 
 		 349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  59.6 
 
 		 333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  54.49 
 
 		 336 aa  355  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  52.92 
 
 		 366 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  51.98 
 
 		 354 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  54.78 
 
 		 332 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  51.85 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  53.49 
 
 		 332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  52.12 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.22 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  49.33 
 
 		 381 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  55.08 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  52.47 
 
 		 359 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  51.38 
 
 		 391 aa  351  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  53.2 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  56.13 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  51.13 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.43 
 
 		 351 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  53.49 
 
 		 333 aa  349  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  51.4 
 
 		 364 aa  349  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  53.46 
 
 		 367 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  51.38 
 
 		 381 aa  348  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  55.26 
 
 		 342 aa  348  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 379 aa  348  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  50.7 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  53.15 
 
 		 370 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.08 
 
 		 369 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 380 aa  348  8e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.37 
 
 		 369 aa  348  9e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  52.22 
 
 		 380 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  53.2 
 
 		 333 aa  347  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  51.11 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  52.49 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.56 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  51.83 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.86 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  52.65 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  49.72 
 
 		 371 aa  346  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  52.05 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.33 
 
 		 369 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  52.22 
 
 		 376 aa  346  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  53.51 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  51.69 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  53.04 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.56 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  51.57 
 
 		 352 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.03 
 
 		 333 aa  345  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  52.51 
 
 		 359 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  52.59 
 
 		 352 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 		 373 aa  345  8e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.56 
 
 		 358 aa  345  8e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  50.28 
 
 		 352 aa  345  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  52.37 
 
 		 395 aa  345  8.999999999999999e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.14 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  51.52 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  51.38 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  52.29 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  51.44 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>