More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2642 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  97 
 
 
333 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  100 
 
 
334 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  79.64 
 
 
336 aa  550  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  76.88 
 
 
333 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  76.28 
 
 
333 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  76.28 
 
 
333 aa  541  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  74.1 
 
 
333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  65.17 
 
 
344 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  61.66 
 
 
332 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  61.66 
 
 
332 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  61.86 
 
 
333 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  65.77 
 
 
330 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  62.58 
 
 
332 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  60.43 
 
 
332 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  60.84 
 
 
332 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  60.84 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  59.4 
 
 
335 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  59.94 
 
 
332 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  59.64 
 
 
332 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  62.46 
 
 
325 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  61.23 
 
 
325 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  57.83 
 
 
338 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  58.13 
 
 
336 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  61.35 
 
 
332 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  59.34 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  58.97 
 
 
334 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  57.53 
 
 
342 aa  394  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  57.66 
 
 
333 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.06 
 
 
333 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.06 
 
 
333 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  57.8 
 
 
334 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  61.96 
 
 
331 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  58.28 
 
 
332 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  58.41 
 
 
334 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  56.76 
 
 
341 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.24 
 
 
368 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  52.37 
 
 
372 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  54.6 
 
 
338 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  56.16 
 
 
349 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  55.99 
 
 
333 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.06 
 
 
358 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  57.93 
 
 
334 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  53.82 
 
 
342 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.96 
 
 
365 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  52.91 
 
 
369 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  54.02 
 
 
369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  59.93 
 
 
345 aa  361  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50.95 
 
 
370 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  52.94 
 
 
358 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  51.24 
 
 
370 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  52.89 
 
 
369 aa  358  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.91 
 
 
369 aa  358  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  49.59 
 
 
381 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 
373 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  57.01 
 
 
372 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  52.11 
 
 
363 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.37 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  54.1 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  50.97 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.83 
 
 
370 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.42 
 
 
369 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  51.69 
 
 
366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  53.91 
 
 
374 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  53.19 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  52.51 
 
 
366 aa  355  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  57.84 
 
 
352 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  51 
 
 
359 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  57.23 
 
 
363 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  50.71 
 
 
353 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.91 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  51.67 
 
 
357 aa  354  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  51.93 
 
 
363 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  54.21 
 
 
381 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.19 
 
 
376 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.29 
 
 
362 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  52.53 
 
 
368 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  53.82 
 
 
362 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  54.33 
 
 
333 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.91 
 
 
369 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  54.86 
 
 
364 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  54.81 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.91 
 
 
380 aa  352  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.19 
 
 
368 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.19 
 
 
368 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  51.83 
 
 
378 aa  352  7e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  50.99 
 
 
359 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  51.67 
 
 
369 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  53.17 
 
 
362 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  55.1 
 
 
368 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  52.89 
 
 
362 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  55.22 
 
 
351 aa  348  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  54.46 
 
 
350 aa  348  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  50.14 
 
 
379 aa  348  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  51.54 
 
 
368 aa  348  9e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  53.47 
 
 
377 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  50.56 
 
 
364 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  51.97 
 
 
359 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.15 
 
 
351 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  48.75 
 
 
371 aa  346  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
370 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>