More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1353 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  100 
 
 
344 aa  702    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  69.79 
 
 
331 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  65.17 
 
 
333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  64.44 
 
 
333 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 
333 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  65.17 
 
 
334 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  64.86 
 
 
333 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 
333 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  64.67 
 
 
336 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  63.25 
 
 
330 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  54.24 
 
 
352 aa  381  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  59.08 
 
 
325 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  56.84 
 
 
332 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  52.52 
 
 
338 aa  374  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  54.39 
 
 
361 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  55.33 
 
 
336 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  56.84 
 
 
332 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  56.84 
 
 
332 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  54.11 
 
 
361 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  57.19 
 
 
333 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  55.32 
 
 
332 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  55.93 
 
 
332 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  55.62 
 
 
332 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.6 
 
 
372 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  54.85 
 
 
333 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  53.59 
 
 
338 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.95 
 
 
335 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  59.54 
 
 
325 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  50.28 
 
 
366 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
368 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  54.17 
 
 
333 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  54.44 
 
 
368 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  52.75 
 
 
370 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  55.26 
 
 
333 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  50 
 
 
368 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  51.68 
 
 
360 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.39 
 
 
376 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  51.4 
 
 
360 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50.83 
 
 
369 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
333 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  52.69 
 
 
357 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  55.15 
 
 
341 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  52.65 
 
 
359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  53.62 
 
 
368 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.82 
 
 
380 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  54.35 
 
 
332 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  54.65 
 
 
332 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 
333 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  55.52 
 
 
334 aa  359  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  53.64 
 
 
342 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  55.42 
 
 
332 aa  359  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  51.8 
 
 
361 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  51.69 
 
 
358 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  50.69 
 
 
360 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  54.65 
 
 
334 aa  358  8e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  51.97 
 
 
358 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  52.63 
 
 
362 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  51.84 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  50.85 
 
 
353 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.12 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.84 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.25 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.51 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.12 
 
 
395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  54.63 
 
 
334 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.25 
 
 
368 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  50.97 
 
 
359 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  50.42 
 
 
360 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  52.82 
 
 
359 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  53.19 
 
 
362 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  52.85 
 
 
342 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  51.1 
 
 
361 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  53.66 
 
 
332 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  51.57 
 
 
351 aa  353  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  48.92 
 
 
377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  50.55 
 
 
361 aa  352  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  50.42 
 
 
367 aa  352  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  49.73 
 
 
367 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  51.83 
 
 
354 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  50.7 
 
 
375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  53.22 
 
 
362 aa  351  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  51.71 
 
 
363 aa  351  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  51.67 
 
 
366 aa  351  8.999999999999999e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  49.31 
 
 
364 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  53.8 
 
 
349 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  50.42 
 
 
370 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  52.08 
 
 
362 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  55.8 
 
 
361 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  50.14 
 
 
357 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  50.99 
 
 
377 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  52.53 
 
 
374 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  51.71 
 
 
363 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  50.56 
 
 
372 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  50.55 
 
 
369 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  50.68 
 
 
366 aa  347  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
369 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  51.75 
 
 
384 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  53.5 
 
 
333 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
369 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
369 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>