More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6535 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  100 
 
 		 325 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  93.23 
 
 		 325 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  65.44 
 
 		 334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  62.77 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  62.15 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  61.23 
 
 		 332 aa  407  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  61.23 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  61.23 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  60.92 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  60.62 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  59.38 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  61.54 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  59.38 
 
 		 332 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  59.08 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  59.38 
 
 		 332 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  59.38 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  59.51 
 
 		 342 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  59.82 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.12 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.08 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.12 
 
 		 333 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  59.35 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  58.77 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  58.46 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  57.36 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.46 
 
 		 333 aa  384  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.9 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  58.59 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  58.46 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  59.2 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  61.94 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  57.54 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  57.06 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  57.67 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  57.67 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.13 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  54.26 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  57.36 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  59.54 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  61.59 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  57.5 
 
 		 381 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  61.49 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  57.62 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  56.93 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  61.27 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  58.01 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  55.42 
 
 		 372 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  55.45 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  52.96 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  57.83 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.12 
 
 		 368 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  55 
 
 		 361 aa  358  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.97 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  54.83 
 
 		 368 aa  358  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  67.82 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.33 
 
 		 358 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  53.01 
 
 		 370 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  55.12 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  53.01 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  56.29 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.78 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.85 
 
 		 373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.65 
 
 		 349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  54.41 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  53.11 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  68.02 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  50.6 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  55.08 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  54.92 
 
 		 353 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  55.09 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 361 aa  351  8.999999999999999e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.97 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  57.79 
 
 		 355 aa  350  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  55.87 
 
 		 333 aa  349  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  58.41 
 
 		 375 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  54.52 
 
 		 359 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  55.69 
 
 		 331 aa  349  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  57.01 
 
 		 377 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  54.55 
 
 		 351 aa  348  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  55.42 
 
 		 361 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  52.33 
 
 		 379 aa  348  6e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  60.21 
 
 		 353 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.49 
 
 		 369 aa  346  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.49 
 
 		 369 aa  346  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  53.13 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.49 
 
 		 369 aa  346  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.94 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.92 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  57.63 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.92 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  56.87 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  53.14 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  53.87 
 
 		 360 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  53.01 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  55.15 
 
 		 352 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  52.66 
 
 		 357 aa  345  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  55.84 
 
 		 369 aa  345  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>