More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3400 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  100 
 
 		 336 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  79.64 
 
 		 334 aa  550  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  80.18 
 
 		 333 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  74.77 
 
 		 333 aa  529  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  74.77 
 
 		 333 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  74.17 
 
 		 333 aa  522  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  76.2 
 
 		 333 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  67.87 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  62.65 
 
 		 332 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  63.25 
 
 		 332 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  63.66 
 
 		 335 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  63.83 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  63.06 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  64.67 
 
 		 344 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  62.61 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  62.65 
 
 		 332 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  62.35 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  62.31 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  62.35 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  61.75 
 
 		 332 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  62.77 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  63.08 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  59.76 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  58.97 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  62.42 
 
 		 332 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  58.56 
 
 		 341 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  60.61 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  61.09 
 
 		 332 aa  404  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  58.91 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  60.3 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  62.92 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  60.3 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.93 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  56.72 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  54.6 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.89 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  53.48 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  57.66 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  56.29 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  57.26 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  56.59 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  58.17 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  53.76 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.52 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.14 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.4 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.28 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.87 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  54.72 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.93 
 
 		 358 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  53.78 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  56.46 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.34 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  56.06 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.81 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  55.65 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  51.63 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  53.95 
 
 		 378 aa  362  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  53.78 
 
 		 366 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  53.65 
 
 		 363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.91 
 
 		 369 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  58.23 
 
 		 365 aa  359  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.34 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  54.47 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 		 370 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  51.26 
 
 		 364 aa  358  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  52.82 
 
 		 363 aa  358  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  53.89 
 
 		 361 aa  358  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  55.33 
 
 		 345 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 361 aa  358  9e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  55.69 
 
 		 350 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  53.93 
 
 		 363 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  58.92 
 
 		 368 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.63 
 
 		 369 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  55.76 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.91 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  52.82 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  55.12 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  53.04 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  54.19 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  52.37 
 
 		 359 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  54.34 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  53.87 
 
 		 352 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  54.32 
 
 		 362 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  53.04 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.59 
 
 		 370 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  52.92 
 
 		 375 aa  355  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.35 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  51.93 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.04 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  51.25 
 
 		 377 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  52.38 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>