More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4119 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  100 
 
 		 338 aa  696    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  69.58 
 
 		 332 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  69.28 
 
 		 332 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  68.07 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  67.77 
 
 		 332 aa  475  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  69.28 
 
 		 332 aa  474  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  68.07 
 
 		 332 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  68.98 
 
 		 332 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  70.06 
 
 		 334 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  67.77 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  68.58 
 
 		 334 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  67.27 
 
 		 332 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  66.87 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  65.36 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  66.67 
 
 		 334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  65.36 
 
 		 332 aa  444  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  65.17 
 
 		 335 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  59.27 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  58.66 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  58.97 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  57.83 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.75 
 
 		 333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.45 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  57.23 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  55 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.92 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  60.65 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  57.86 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  59.35 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  54.49 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  52.37 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  54.6 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  52.84 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  52.52 
 
 		 344 aa  374  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  58.19 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  57.93 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  55.56 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.89 
 
 		 365 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  51.36 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  55.46 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  58.62 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  54.19 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  54.47 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50.82 
 
 		 370 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.54 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  52.92 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  52.92 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  56.06 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.94 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.06 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  54.47 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  54.82 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  55.42 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  57.19 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  53.2 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.76 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  51.9 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  50.54 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  53.48 
 
 		 359 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  54.57 
 
 		 341 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  51.58 
 
 		 361 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.99 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  53.94 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  51.97 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  54 
 
 		 352 aa  358  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  56.56 
 
 		 377 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  49.72 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.19 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.15 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.43 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  55.38 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  55.84 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  51.69 
 
 		 367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  51.38 
 
 		 364 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  56.15 
 
 		 369 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  57.83 
 
 		 377 aa  355  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  51.43 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  52.51 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  52.92 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  50.85 
 
 		 360 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  50.72 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  53.18 
 
 		 351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.81 
 
 		 359 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  53.78 
 
 		 333 aa  352  7e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  55.7 
 
 		 369 aa  351  8e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  54.75 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  53.11 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  55.06 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  55.06 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  53.98 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  53.39 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.92 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  51.39 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  51.09 
 
 		 368 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.39 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  52.38 
 
 		 366 aa  349  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>