More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5593 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  100 
 
 		 352 aa  705    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  79.14 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  68.39 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  65.64 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  56.77 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  56.29 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  55.41 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  53.41 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  59.81 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  54.37 
 
 		 368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  54.47 
 
 		 372 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  53.24 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  55.33 
 
 		 332 aa  359  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  56.13 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  54 
 
 		 338 aa  358  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.86 
 
 		 362 aa  358  8e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  55.33 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  53.85 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.08 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  55.59 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  54.7 
 
 		 378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  55.04 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.85 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.57 
 
 		 391 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  53.87 
 
 		 336 aa  355  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  55.59 
 
 		 342 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.28 
 
 		 380 aa  355  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  57.84 
 
 		 334 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  53.56 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  58.31 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  53.56 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.28 
 
 		 376 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  52.97 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  55.56 
 
 		 332 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  51.5 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  54.57 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  52.59 
 
 		 362 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  55.62 
 
 		 354 aa  352  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 333 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.18 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  54.22 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  54.75 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  53.56 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 		 333 aa  348  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  51.38 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  52.85 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  50.14 
 
 		 381 aa  348  9e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  57.01 
 
 		 333 aa  348  9e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  51.09 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.19 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 380 aa  347  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  54.22 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  54.55 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.26 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  59.8 
 
 		 332 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  55.15 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.1 
 
 		 352 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  51.78 
 
 		 358 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  51.77 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  51.52 
 
 		 359 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  51.37 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.38 
 
 		 353 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.54 
 
 		 349 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  50.27 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  54.42 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  50.97 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  49.08 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  52.65 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  50.81 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  52 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  51.25 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  49.08 
 
 		 381 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  52.51 
 
 		 352 aa  342  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  51.5 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  53.43 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  51.12 
 
 		 352 aa  342  7e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  54.76 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  52.69 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 351 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  50.96 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  50.97 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  48.8 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  50.14 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  52.52 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.16 
 
 		 369 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.85 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  51.68 
 
 		 351 aa  339  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.63 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.25 
 
 		 356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.66 
 
 		 370 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  54.19 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  51.11 
 
 		 354 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  53.16 
 
 		 334 aa  338  9e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  49.72 
 
 		 353 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  50.69 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.7 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>