More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5494 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  100 
 
 
341 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  77.71 
 
 
342 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  76.28 
 
 
333 aa  542  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  75.68 
 
 
333 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  74.77 
 
 
333 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  65.4 
 
 
342 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  67.89 
 
 
333 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  58.56 
 
 
336 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  58.56 
 
 
333 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  56.63 
 
 
362 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  59.46 
 
 
332 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  56.76 
 
 
333 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  56.76 
 
 
334 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.38 
 
 
335 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  60.12 
 
 
334 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  58.59 
 
 
325 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  58.79 
 
 
333 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  55.77 
 
 
374 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.43 
 
 
373 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  56.76 
 
 
332 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  55.56 
 
 
333 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.86 
 
 
333 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  55.25 
 
 
362 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  55.99 
 
 
362 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  57.36 
 
 
332 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  55.86 
 
 
332 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  52.33 
 
 
371 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.26 
 
 
333 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  57.06 
 
 
325 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  55.86 
 
 
333 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  57.66 
 
 
332 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  55.56 
 
 
332 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  54.87 
 
 
362 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.33 
 
 
332 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  57.96 
 
 
332 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  56.76 
 
 
332 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  56.76 
 
 
332 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  55.56 
 
 
336 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  53.59 
 
 
369 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  54.14 
 
 
362 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  55.99 
 
 
332 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  53.57 
 
 
366 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  56.19 
 
 
334 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  54.64 
 
 
379 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  57.1 
 
 
334 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.13 
 
 
369 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.47 
 
 
365 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.86 
 
 
369 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  52.76 
 
 
369 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  54.34 
 
 
366 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  55.15 
 
 
344 aa  362  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.86 
 
 
369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.02 
 
 
369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  54.57 
 
 
338 aa  362  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.41 
 
 
368 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.41 
 
 
368 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  54.78 
 
 
345 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  50.27 
 
 
372 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.45 
 
 
351 aa  358  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  52.76 
 
 
368 aa  357  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.04 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  57.83 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.32 
 
 
369 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  49.46 
 
 
368 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  55.56 
 
 
331 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50.13 
 
 
370 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  51.53 
 
 
359 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  54.83 
 
 
350 aa  352  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  52.47 
 
 
375 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  51.08 
 
 
369 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.13 
 
 
370 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  56.16 
 
 
330 aa  350  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.85 
 
 
359 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  54.75 
 
 
352 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 
357 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  52.33 
 
 
369 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.22 
 
 
361 aa  349  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  51.09 
 
 
367 aa  348  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  55.56 
 
 
335 aa  348  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  53.51 
 
 
353 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  51.52 
 
 
368 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  53.2 
 
 
395 aa  348  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1648  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein  52.54 
 
 
373 aa  347  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.43035  hitchhiker  0.00000048484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  50.84 
 
 
380 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.34 
 
 
370 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  54.82 
 
 
335 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  53.22 
 
 
353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.41 
 
 
372 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  49.87 
 
 
370 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  51.21 
 
 
391 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  54.44 
 
 
338 aa  345  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.28 
 
 
381 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  50.55 
 
 
377 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1516  ABC transporter related  56.69 
 
 
369 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00369229  normal  0.0599486 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.72 
 
 
351 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  51.25 
 
 
376 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  52.68 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  51.11 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.72 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>