More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3780 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  100 
 
 		 332 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  75.3 
 
 		 333 aa  524  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  73.8 
 
 		 332 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  73.19 
 
 		 332 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  74.1 
 
 		 332 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  73.19 
 
 		 332 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  73.11 
 
 		 332 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  72.59 
 
 		 332 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  73.49 
 
 		 332 aa  501  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  71.99 
 
 		 332 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  71.77 
 
 		 334 aa  494  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  72.07 
 
 		 334 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  70.27 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  68.67 
 
 		 336 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  72.04 
 
 		 332 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  68.47 
 
 		 335 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  65.36 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.45 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.14 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  63.69 
 
 		 325 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  62.35 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  60.54 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  60.24 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  59.94 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  59.64 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  62.15 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.46 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  58.46 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.86 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  57.23 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  57.66 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  57.23 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  57.66 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  57.36 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.06 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  54.6 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  54.04 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  58.1 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  57.19 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  54.14 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  55.81 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  53.31 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.04 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  58.62 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  55.75 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.42 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  53.78 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.21 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  56.97 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.06 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  53.48 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  55.81 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.49 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.92 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  53.5 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  53.63 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  57.75 
 
 		 330 aa  362  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 		 369 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.24 
 
 		 359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  57.14 
 
 		 331 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.92 
 
 		 373 aa  361  8e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  53.76 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  52.21 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  52.21 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  51.93 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  55.42 
 
 		 344 aa  359  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  49.58 
 
 		 364 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  51.38 
 
 		 369 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  55.33 
 
 		 352 aa  359  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  52.1 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  53.41 
 
 		 374 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.37 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  52.15 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.37 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  52.6 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.37 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  51.38 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  53.78 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  51.38 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.06 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  48.88 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  51.78 
 
 		 369 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  50.96 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  54.36 
 
 		 351 aa  355  5e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  53.06 
 
 		 368 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  51.81 
 
 		 362 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  53.63 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  51.27 
 
 		 380 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.22 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.24 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  54.44 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 395 aa  352  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.53 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  52.65 
 
 		 375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  52.5 
 
 		 368 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  52.54 
 
 		 367 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  53.07 
 
 		 365 aa  351  8e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>