More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3809 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  100 
 
 		 342 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  80.12 
 
 		 333 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  77.71 
 
 		 341 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  79.52 
 
 		 333 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  77.78 
 
 		 333 aa  552  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  65.76 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  65.96 
 
 		 333 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  58.84 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  61.35 
 
 		 325 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  58.91 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  57.53 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  58.48 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  58.13 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  57.53 
 
 		 334 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  57.1 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  59.21 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  59.51 
 
 		 325 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  56.33 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  56.55 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  57.14 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  58.43 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  56.5 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.93 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  56.33 
 
 		 332 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  56.93 
 
 		 332 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  57.23 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  56.93 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  56.33 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  57.06 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  56.02 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  56.02 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  56.5 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  55.12 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.68 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  56.15 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  55.72 
 
 		 332 aa  381  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  55.42 
 
 		 332 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.09 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.49 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.17 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  55.59 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  55.65 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.82 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  56.23 
 
 		 345 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  57.23 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  54.49 
 
 		 366 aa  371  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  51.08 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  52.51 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  52.49 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  54.7 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.7 
 
 		 376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  55.03 
 
 		 357 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  51.66 
 
 		 370 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  53.31 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  55.76 
 
 		 331 aa  360  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  53.94 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  57.4 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  52.82 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  53.04 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  51.98 
 
 		 359 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1648  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein  53.76 
 
 		 373 aa  359  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.43035  hitchhiker  0.00000048484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  51.38 
 
 		 367 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  52.35 
 
 		 368 aa  359  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  53.46 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  53.64 
 
 		 344 aa  359  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 379 aa  359  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 395 aa  358  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  53.46 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  55.43 
 
 		 350 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.39 
 
 		 349 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  51.12 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  54.79 
 
 		 335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.22 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  51.49 
 
 		 368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.46 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  51.38 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.38 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  52.84 
 
 		 354 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  55.59 
 
 		 352 aa  355  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  51.98 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.37 
 
 		 361 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  54.35 
 
 		 335 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1950  ABC transporter related  52.09 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  51.22 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  55.43 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.75 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  51.53 
 
 		 361 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  52.82 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  51.76 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  51.76 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  52.65 
 
 		 354 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.01 
 
 		 351 aa  352  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  51.49 
 
 		 369 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  52.71 
 
 		 356 aa  351  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  52.86 
 
 		 355 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  52.1 
 
 		 357 aa  350  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3303  ABC transporter related  52.94 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700812  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 388 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>