More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3550 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  100 
 
 
333 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  87.69 
 
 
333 aa  614  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  87.09 
 
 
333 aa  609  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  76.28 
 
 
334 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  76.28 
 
 
333 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  74.77 
 
 
336 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  72.89 
 
 
333 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  65.17 
 
 
344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  62.16 
 
 
333 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  60.84 
 
 
332 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  61.86 
 
 
335 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  60.54 
 
 
332 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  62.05 
 
 
332 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  62.35 
 
 
332 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  61.93 
 
 
332 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  62.65 
 
 
336 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  61.14 
 
 
332 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  61.86 
 
 
334 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  59.94 
 
 
332 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  60.54 
 
 
332 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  62.46 
 
 
330 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  58.66 
 
 
338 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  59.64 
 
 
332 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  59.76 
 
 
334 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  59.64 
 
 
332 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  59.7 
 
 
334 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  61.4 
 
 
331 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  57.66 
 
 
333 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  60 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  59.08 
 
 
325 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
333 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  56.33 
 
 
342 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.86 
 
 
333 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  57.57 
 
 
338 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.72 
 
 
332 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  55.56 
 
 
341 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  54.02 
 
 
369 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.91 
 
 
365 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  54.95 
 
 
342 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  56.89 
 
 
333 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  57.49 
 
 
334 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  53.89 
 
 
369 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  52.5 
 
 
372 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  53.39 
 
 
381 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  56.16 
 
 
349 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  54.29 
 
 
369 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  52.09 
 
 
369 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  51.53 
 
 
367 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.25 
 
 
368 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  53.19 
 
 
369 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.24 
 
 
359 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.74 
 
 
369 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.19 
 
 
368 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.29 
 
 
362 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  53.19 
 
 
369 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.19 
 
 
368 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  52.17 
 
 
381 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.91 
 
 
369 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  53.8 
 
 
368 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  54.25 
 
 
362 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  53.06 
 
 
361 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.87 
 
 
370 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.02 
 
 
370 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  52.08 
 
 
369 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  54.95 
 
 
333 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.87 
 
 
370 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.87 
 
 
370 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.87 
 
 
370 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.87 
 
 
388 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.87 
 
 
370 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  53.87 
 
 
370 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50.55 
 
 
370 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  53.98 
 
 
351 aa  364  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.87 
 
 
369 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  52.53 
 
 
364 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.11 
 
 
358 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50.69 
 
 
370 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.06 
 
 
373 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  51.82 
 
 
359 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  53.06 
 
 
362 aa  362  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  53.85 
 
 
352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  52.79 
 
 
366 aa  361  8e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  51.83 
 
 
358 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  50.98 
 
 
359 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 
370 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  53.52 
 
 
368 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
361 aa  360  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.6 
 
 
372 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  55.98 
 
 
349 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  53.39 
 
 
361 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
379 aa  359  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  52.66 
 
 
357 aa  359  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  52.14 
 
 
359 aa  358  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  51.25 
 
 
363 aa  358  9e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  51.82 
 
 
359 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  54.93 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  53.31 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  53.31 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  51.68 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  51.97 
 
 
366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>