More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3427 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  100 
 
 
349 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  56.6 
 
 
338 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  56.94 
 
 
361 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  56.66 
 
 
361 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  56.73 
 
 
352 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  54.96 
 
 
361 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  56.32 
 
 
356 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  53.65 
 
 
353 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.97 
 
 
362 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.47 
 
 
365 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  53.87 
 
 
362 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  53.59 
 
 
362 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  57.43 
 
 
333 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  53.37 
 
 
358 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.81 
 
 
358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  54.17 
 
 
357 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  53.46 
 
 
362 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  55.43 
 
 
333 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  55.98 
 
 
333 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  53.82 
 
 
350 aa  359  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  53.14 
 
 
349 aa  358  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  51.94 
 
 
364 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  56.93 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  53.93 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  53.33 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  55.56 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  52.89 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  52.77 
 
 
350 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  53.85 
 
 
360 aa  355  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.78 
 
 
362 aa  355  5.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  54.97 
 
 
332 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  55.87 
 
 
349 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.31 
 
 
380 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.31 
 
 
376 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.8 
 
 
368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  55.62 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  51.8 
 
 
368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  54.97 
 
 
332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 
333 aa  352  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  53.45 
 
 
353 aa  352  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  55.62 
 
 
332 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  51.81 
 
 
366 aa  352  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  57.96 
 
 
352 aa  352  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  53.99 
 
 
395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 
361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.85 
 
 
359 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.84 
 
 
335 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  54.97 
 
 
332 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  50.95 
 
 
372 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  53.35 
 
 
364 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  52.69 
 
 
364 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  53.8 
 
 
344 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  54.68 
 
 
334 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  53.16 
 
 
355 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  51.38 
 
 
360 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 
369 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  56.51 
 
 
358 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.71 
 
 
354 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 
369 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 
369 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  51.37 
 
 
360 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.08 
 
 
375 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  52.75 
 
 
368 aa  350  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  51.68 
 
 
357 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  52.38 
 
 
359 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  52.99 
 
 
355 aa  349  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  53.56 
 
 
352 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 
369 aa  348  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  53.16 
 
 
356 aa  348  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  54.14 
 
 
332 aa  348  8e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  55.62 
 
 
332 aa  348  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  54.96 
 
 
351 aa  348  9e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  52.21 
 
 
369 aa  348  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 
333 aa  347  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  51.97 
 
 
359 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  52.22 
 
 
368 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
381 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
352 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  51.93 
 
 
374 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  50.28 
 
 
364 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  55 
 
 
365 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  54.25 
 
 
332 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  52.27 
 
 
355 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  52.5 
 
 
380 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  56.87 
 
 
325 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  54.2 
 
 
333 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.28 
 
 
351 aa  345  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  54.34 
 
 
351 aa  345  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  57.69 
 
 
325 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.33 
 
 
350 aa  345  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  52.27 
 
 
357 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  51.38 
 
 
355 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
365 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  53.8 
 
 
333 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.49 
 
 
379 aa  345  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.33 
 
 
350 aa  345  7e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  51.51 
 
 
391 aa  345  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  54.78 
 
 
336 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  54.49 
 
 
342 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>