More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0135 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 350 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  71.31 
 
 		 358 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  73.39 
 
 		 345 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  68.39 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  56.63 
 
 		 378 aa  391  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  55.18 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  57.23 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  55.04 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  56.05 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  56.74 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.83 
 
 		 368 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  53.13 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  54.93 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  55.75 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  54.77 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.19 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  53.11 
 
 		 366 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  55.43 
 
 		 362 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  55.72 
 
 		 333 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  54 
 
 		 364 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  53.24 
 
 		 359 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  53.95 
 
 		 362 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  53.37 
 
 		 357 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  56.61 
 
 		 349 aa  359  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  53.82 
 
 		 349 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  53.14 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  54.57 
 
 		 332 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  53.71 
 
 		 358 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  54.84 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  54.57 
 
 		 332 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  53.98 
 
 		 332 aa  358  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  55.69 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  55.43 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.28 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  55.18 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.97 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  54.55 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  54.57 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  52.22 
 
 		 360 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  55.29 
 
 		 330 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  53.33 
 
 		 370 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  53.53 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.76 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.68 
 
 		 333 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.97 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  54.6 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  54.67 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  54.83 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  53.24 
 
 		 332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  53.35 
 
 		 338 aa  352  7e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  53.33 
 
 		 370 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  53.12 
 
 		 352 aa  352  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  54.57 
 
 		 362 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  52.86 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  53.24 
 
 		 332 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  53.89 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  53.98 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  53.06 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  55.1 
 
 		 354 aa  348  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  53.53 
 
 		 334 aa  348  5e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  53.2 
 
 		 334 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.92 
 
 		 369 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  54.46 
 
 		 334 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  53.31 
 
 		 351 aa  348  9e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  52.94 
 
 		 365 aa  348  9e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  52.8 
 
 		 336 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  53.19 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  54.17 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  53.46 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  52.01 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  53.64 
 
 		 334 aa  346  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1150  ABC transporter related  55.65 
 
 		 372 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  50.98 
 
 		 363 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.6 
 
 		 373 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  52.81 
 
 		 366 aa  345  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.47 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  52.16 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 		 333 aa  345  7e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 373 aa  345  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2870  ABC alpha-glucoside transporter, ATPase subunit AglK  55.31 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0548699  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1516  ABC transporter related  55.31 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00369229  normal  0.0599486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 381 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  53.53 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  51.77 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  53.76 
 
 		 395 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  52.81 
 
 		 377 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.28 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.7 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.2 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  51.12 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  50.56 
 
 		 371 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  51.94 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  50.71 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  53.22 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>