More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0462 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  100 
 
 
365 aa  736    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  60.44 
 
 
372 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  60.5 
 
 
376 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  60.16 
 
 
375 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  60.22 
 
 
380 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  57.3 
 
 
359 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  59.61 
 
 
357 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  57.94 
 
 
367 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  58.26 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  58.54 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  58.06 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.22 
 
 
365 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  54.25 
 
 
370 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  55.46 
 
 
369 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  56.91 
 
 
332 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.99 
 
 
358 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  54.12 
 
 
368 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  54.12 
 
 
368 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  56.82 
 
 
359 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  54.77 
 
 
369 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  60.66 
 
 
395 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  56.63 
 
 
332 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  53.95 
 
 
369 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.97 
 
 
369 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  55.59 
 
 
358 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  53.7 
 
 
369 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  56.86 
 
 
368 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  56.42 
 
 
332 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 
373 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  55.52 
 
 
372 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  53.7 
 
 
379 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  54.52 
 
 
370 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  54.25 
 
 
370 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.62 
 
 
370 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 
370 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  55.1 
 
 
391 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  54.08 
 
 
381 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  56.39 
 
 
362 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 
372 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
370 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
370 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
370 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
388 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
370 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
371 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  53.46 
 
 
369 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  59.5 
 
 
381 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.1 
 
 
370 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  53.87 
 
 
369 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.72 
 
 
369 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  54.01 
 
 
382 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  59.38 
 
 
377 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 
369 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  54.47 
 
 
338 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  54.14 
 
 
360 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  52.79 
 
 
364 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
335 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.34 
 
 
361 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  55.12 
 
 
362 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  54.42 
 
 
371 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
369 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  54.62 
 
 
332 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  55.91 
 
 
364 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  55.37 
 
 
360 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  54.34 
 
 
332 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  55.34 
 
 
362 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
369 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
369 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  56.4 
 
 
360 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  55.19 
 
 
367 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  54.14 
 
 
377 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  56.08 
 
 
366 aa  366  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  55.1 
 
 
362 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  53.48 
 
 
382 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  57.62 
 
 
325 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  54.44 
 
 
377 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  54.47 
 
 
332 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  56.08 
 
 
366 aa  366  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  53.14 
 
 
361 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  57.93 
 
 
325 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  59.19 
 
 
356 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.65 
 
 
359 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.92 
 
 
371 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  53.64 
 
 
382 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.76 
 
 
369 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 
381 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  53.74 
 
 
385 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  53.74 
 
 
385 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  52.65 
 
 
380 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  54.32 
 
 
362 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2353  ABC transporter related  52.55 
 
 
383 aa  361  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  56.57 
 
 
351 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  55.56 
 
 
366 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  53.91 
 
 
349 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  54.24 
 
 
352 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  53.48 
 
 
385 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
361 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  58.23 
 
 
336 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.23 
 
 
332 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  52.82 
 
 
360 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>