More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0292 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  87.6 
 
 
372 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  86.79 
 
 
372 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  100 
 
 
373 aa  773    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  68.02 
 
 
369 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  67.75 
 
 
369 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  67.39 
 
 
371 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  67.39 
 
 
371 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 
369 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  67.39 
 
 
371 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 
369 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 
369 aa  526  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  67.39 
 
 
371 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  67.39 
 
 
371 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  67.39 
 
 
371 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 
369 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 
369 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  67.39 
 
 
371 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 
369 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  67.39 
 
 
371 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 
369 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 
369 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  57.72 
 
 
371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  57.07 
 
 
379 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  57.69 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  57.46 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.35 
 
 
370 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  58.1 
 
 
395 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.63 
 
 
369 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  56.59 
 
 
368 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  56.59 
 
 
368 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 
370 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 
370 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 
370 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 
370 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  56.2 
 
 
369 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 
370 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.35 
 
 
370 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  57.3 
 
 
369 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  56.35 
 
 
369 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 
388 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  55.34 
 
 
375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  55.65 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  55.37 
 
 
369 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.23 
 
 
365 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  54.27 
 
 
360 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  56.32 
 
 
369 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  53.87 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  52.89 
 
 
385 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  54.05 
 
 
382 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  53.49 
 
 
385 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  54.42 
 
 
362 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  53.49 
 
 
385 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  53.89 
 
 
369 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  57.02 
 
 
359 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.95 
 
 
362 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.64 
 
 
376 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  52.79 
 
 
364 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.1 
 
 
380 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  51.65 
 
 
391 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2353  ABC transporter related  53.07 
 
 
383 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  52.43 
 
 
382 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  50.55 
 
 
371 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  52.7 
 
 
382 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  53.48 
 
 
357 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  55.52 
 
 
365 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1185  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  51.75 
 
 
414 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
381 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  54.44 
 
 
367 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  53.33 
 
 
368 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  54.72 
 
 
364 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  53.04 
 
 
362 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.26 
 
 
368 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  50.94 
 
 
377 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  50.67 
 
 
377 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.07 
 
 
362 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
361 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  50.53 
 
 
384 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  51.68 
 
 
369 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.32 
 
 
358 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.07 
 
 
373 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  52.79 
 
 
363 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3244  ABC transporter-related protein  51.03 
 
 
390 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  50.94 
 
 
377 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2277  ABC transporter related  52.3 
 
 
380 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.93491  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  50.13 
 
 
377 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0947  ABC transporter related  52.65 
 
 
384 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2169  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 
380 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000263472  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.35 
 
 
357 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  51.81 
 
 
380 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  49.72 
 
 
372 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  49.86 
 
 
368 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
368 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  51.52 
 
 
362 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  53.52 
 
 
363 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  51.64 
 
 
370 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3324  ABC transporter-related protein  51.04 
 
 
378 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  52.04 
 
 
363 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  51.4 
 
 
360 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  50.41 
 
 
366 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  53.74 
 
 
358 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>