More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2649 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  100 
 
 
381 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  92.13 
 
 
381 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.16 
 
 
359 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  55.52 
 
 
325 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  54.08 
 
 
365 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.55 
 
 
365 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  50.81 
 
 
379 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  55.32 
 
 
357 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  54.26 
 
 
325 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  52.69 
 
 
351 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  52.17 
 
 
333 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  51.21 
 
 
380 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  51.48 
 
 
376 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  52.17 
 
 
395 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  52.69 
 
 
359 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  51.62 
 
 
372 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  51.76 
 
 
368 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  50.67 
 
 
361 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 
381 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
333 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  50.8 
 
 
364 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 
335 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  52.56 
 
 
377 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  50.54 
 
 
338 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  51.63 
 
 
333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  51.6 
 
 
360 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  50.96 
 
 
353 aa  361  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  49.73 
 
 
368 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
368 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  51.58 
 
 
359 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  51.63 
 
 
332 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  51.36 
 
 
333 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.45 
 
 
371 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  52.13 
 
 
359 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  52.66 
 
 
361 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.09 
 
 
375 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  51.09 
 
 
380 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  52.56 
 
 
364 aa  359  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  50.27 
 
 
363 aa  358  7e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  50.13 
 
 
357 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.62 
 
 
333 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  50.27 
 
 
332 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  49.19 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  51.61 
 
 
358 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  54.32 
 
 
332 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  49.59 
 
 
334 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.61 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  55.42 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  51.36 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  55.42 
 
 
358 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  50 
 
 
332 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  50.27 
 
 
369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  49.32 
 
 
333 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  50.27 
 
 
332 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  49.87 
 
 
363 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
361 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  51.6 
 
 
371 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  49.87 
 
 
377 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  49.18 
 
 
361 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  48.37 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  49.46 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  50.27 
 
 
351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  48.11 
 
 
360 aa  352  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  50.54 
 
 
363 aa  352  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  50.54 
 
 
367 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  49.33 
 
 
345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  47.84 
 
 
360 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  57.01 
 
 
369 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  50.27 
 
 
391 aa  352  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  51.2 
 
 
334 aa  352  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  50.27 
 
 
363 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  54.01 
 
 
353 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  50.54 
 
 
336 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  54.95 
 
 
369 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.03 
 
 
362 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  49.46 
 
 
336 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  49.21 
 
 
368 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  50.27 
 
 
362 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  49.19 
 
 
361 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  50.54 
 
 
356 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  51.63 
 
 
332 aa  349  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  50.54 
 
 
369 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  56.07 
 
 
369 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  50.27 
 
 
352 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  50.27 
 
 
332 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  49.46 
 
 
370 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  48.14 
 
 
360 aa  348  9e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  56.04 
 
 
369 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  48.14 
 
 
366 aa  347  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  49.33 
 
 
355 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  51.19 
 
 
362 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  47.03 
 
 
371 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  47.55 
 
 
372 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  55.66 
 
 
353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  49.87 
 
 
377 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
374 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  53.87 
 
 
367 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.34 
 
 
359 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.85 
 
 
369 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>