More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3453 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  100 
 
 		 377 aa  752    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  55.38 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.74 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  53.51 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0751  ABC transporter related  52.45 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.37 
 
 		 365 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  52.62 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  52.34 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  52.5 
 
 		 352 aa  359  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  49.34 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  50.69 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  50.41 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.15 
 
 		 391 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  50.27 
 
 		 363 aa  355  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  50.27 
 
 		 359 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  48.66 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  51.61 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  50.14 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  51.85 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  52.12 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  51.81 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  51.81 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  50.41 
 
 		 368 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  48.61 
 
 		 353 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  51.97 
 
 		 385 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  50 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  49.87 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  49.47 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  49.47 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  49.87 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  51.85 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  52.62 
 
 		 351 aa  349  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2277  ABC transporter related  51.19 
 
 		 380 aa  348  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.93491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  48.27 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2169  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.93 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000263472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  51.35 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  49.06 
 
 		 381 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  50.54 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50.14 
 
 		 370 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  54.6 
 
 		 374 aa  345  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 381 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  49.87 
 
 		 384 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  48.54 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  49.34 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  50.67 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  49.07 
 
 		 368 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  49.07 
 
 		 368 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  48.01 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 		 361 aa  342  7e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 379 aa  342  9e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  45.21 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.14 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  48.28 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  47.2 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.89 
 
 		 359 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  50.14 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  47.2 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  47.93 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  52.22 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  49.04 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  50.14 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.96 
 
 		 381 aa  339  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  49.03 
 
 		 358 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  47.59 
 
 		 371 aa  338  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  49.86 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  51.12 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  49.72 
 
 		 351 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  48.92 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  50.68 
 
 		 332 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  50.27 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  50.14 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  50.56 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  47.51 
 
 		 380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2353  ABC transporter related  49.74 
 
 		 383 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  49.86 
 
 		 352 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.16 
 
 		 369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  49.29 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  50.91 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  48.64 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>