More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1702 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  93.04 
 
 
359 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  53.74 
 
 
372 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  56.74 
 
 
357 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  57.06 
 
 
368 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  56.78 
 
 
368 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  54.93 
 
 
364 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  54.06 
 
 
368 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  53.37 
 
 
363 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  57.72 
 
 
372 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.32 
 
 
376 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  51.84 
 
 
367 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  54.27 
 
 
370 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  53.2 
 
 
367 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  52.76 
 
 
364 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.76 
 
 
380 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  53.48 
 
 
359 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  55.81 
 
 
352 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.62 
 
 
365 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  53.54 
 
 
363 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  53.59 
 
 
370 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  53.52 
 
 
358 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  53.93 
 
 
332 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  51.25 
 
 
353 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  53.37 
 
 
363 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  51.79 
 
 
366 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  53.93 
 
 
332 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  52.47 
 
 
369 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  52.22 
 
 
369 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  53.09 
 
 
358 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  53.2 
 
 
338 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.94 
 
 
369 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 
356 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  54.27 
 
 
370 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  54.27 
 
 
370 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  53.65 
 
 
332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.17 
 
 
356 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 
356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  48.9 
 
 
368 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 
368 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  53.76 
 
 
332 aa  361  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  51.58 
 
 
381 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  51.91 
 
 
369 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  54.21 
 
 
333 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 
356 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 
363 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  53.26 
 
 
357 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  50.98 
 
 
333 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  51.64 
 
 
369 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  53.48 
 
 
332 aa  359  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  54.55 
 
 
334 aa  360  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  51.32 
 
 
381 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  50.28 
 
 
363 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  52.82 
 
 
361 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  50.97 
 
 
361 aa  359  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  52.62 
 
 
356 aa  359  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  52.62 
 
 
356 aa  359  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  50.98 
 
 
359 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.62 
 
 
356 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.5 
 
 
357 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  50.27 
 
 
369 aa  358  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.22 
 
 
356 aa  358  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  53.2 
 
 
332 aa  358  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.62 
 
 
356 aa  358  7e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  51.27 
 
 
356 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.62 
 
 
356 aa  358  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.62 
 
 
356 aa  358  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  48.9 
 
 
366 aa  358  8e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.62 
 
 
356 aa  358  9e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  51.62 
 
 
377 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.78 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.27 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  50.4 
 
 
385 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  52.37 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  51.67 
 
 
360 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  50.55 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  50.54 
 
 
382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.47 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.94 
 
 
370 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  51.82 
 
 
366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.76 
 
 
362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  50.71 
 
 
356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.98 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  51.52 
 
 
377 aa  356  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.79 
 
 
356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.46 
 
 
369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  52.5 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  50.4 
 
 
385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  50.4 
 
 
385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  50.97 
 
 
344 aa  355  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.66 
 
 
375 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>