More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5360 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  92.93 
 
 
368 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  100 
 
 
368 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  72.88 
 
 
372 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  60.22 
 
 
363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  60.16 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  58.58 
 
 
366 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  59.07 
 
 
363 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  56.63 
 
 
364 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  57.06 
 
 
357 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  52.89 
 
 
368 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  58.19 
 
 
359 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  57.06 
 
 
359 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  50.96 
 
 
372 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  53.54 
 
 
367 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  51.89 
 
 
370 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  54.78 
 
 
355 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  55.87 
 
 
359 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  53.07 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55 
 
 
365 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.63 
 
 
360 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  55.34 
 
 
355 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  54.22 
 
 
371 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.31 
 
 
395 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  52.81 
 
 
369 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  52.68 
 
 
356 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  56.41 
 
 
358 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.87 
 
 
358 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  57.1 
 
 
361 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  54.29 
 
 
357 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  52.21 
 
 
371 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  53.65 
 
 
353 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  53.37 
 
 
354 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  55.96 
 
 
332 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  53.8 
 
 
333 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  54.17 
 
 
332 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  51.83 
 
 
367 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  54.74 
 
 
364 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.76 
 
 
349 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  54.44 
 
 
344 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  54.84 
 
 
364 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  54.72 
 
 
380 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  52.63 
 
 
357 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  53.8 
 
 
362 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.44 
 
 
349 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  53.37 
 
 
353 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.83 
 
 
356 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  53.52 
 
 
332 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.48 
 
 
349 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 
332 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.44 
 
 
376 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  52.75 
 
 
371 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  52.35 
 
 
375 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  53.95 
 
 
357 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  53.48 
 
 
332 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  53.63 
 
 
352 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  54.26 
 
 
332 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  52.07 
 
 
350 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  54.86 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  53.09 
 
 
355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  53.01 
 
 
336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  55.97 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 
371 aa  362  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  53.48 
 
 
333 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  53.02 
 
 
377 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 
370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50.54 
 
 
370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.09 
 
 
379 aa  362  8e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.65 
 
 
361 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  52.17 
 
 
369 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.21 
 
 
373 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  52.91 
 
 
357 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.42 
 
 
365 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  51.52 
 
 
369 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.7 
 
 
365 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  54.32 
 
 
351 aa  360  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  52.5 
 
 
357 aa  359  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.47 
 
 
391 aa  359  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
333 aa  359  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
381 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  53.09 
 
 
355 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 
373 aa  358  7e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  52.53 
 
 
360 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.6 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  58.92 
 
 
336 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  53.59 
 
 
385 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  53.42 
 
 
370 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  55.4 
 
 
364 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.78 
 
 
354 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  55.59 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  53.11 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  54.08 
 
 
334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 
361 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.96 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  52.04 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.96 
 
 
349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>