More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4163 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  100 
 
 		 361 aa  732    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  72.58 
 
 		 361 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  72.3 
 
 		 361 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  57.34 
 
 		 365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  56.67 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  57.66 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  59.21 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  57.7 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  53.93 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  55.31 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  58.03 
 
 		 351 aa  381  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.03 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  56.74 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  51.68 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  56.11 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  54.04 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.52 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  54.34 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  54.96 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  53.26 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.97 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  51.98 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  51.67 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  53.63 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.22 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  51.4 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  55 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  50.84 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  52.1 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.78 
 
 		 380 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.5 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  56.48 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  54.32 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  50.14 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  54.78 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.11 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  51.81 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  54.75 
 
 		 359 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.87 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  51.68 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  53.61 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2277  ABC transporter related  50.14 
 
 		 380 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.93491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.94 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2169  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.14 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000263472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.39 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  54.86 
 
 		 368 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 361 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 372 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.74 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  58.92 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.33 
 
 		 370 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.48 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  53.48 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.97 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  53.24 
 
 		 332 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  52.81 
 
 		 385 aa  359  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  52.66 
 
 		 381 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.01 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  49.44 
 
 		 368 aa  358  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  56.79 
 
 		 368 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  59.42 
 
 		 333 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  57.78 
 
 		 369 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.11 
 
 		 369 aa  358  9e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.11 
 
 		 369 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  54.39 
 
 		 330 aa  358  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.11 
 
 		 369 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  52.96 
 
 		 332 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  48.87 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.72 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0880635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  57.68 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  53.78 
 
 		 332 aa  355  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.1 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.35 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.63 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.44 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  51.69 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  49.29 
 
 		 364 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  53.93 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  52.51 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  55.19 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  51.85 
 
 		 353 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  49.73 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  55.03 
 
 		 359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  51.66 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.63 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  54.81 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  53.56 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  53.65 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  53.95 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.54 
 
 		 349 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>