More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5140 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  100 
 
 		 360 aa  726    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0880635  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  57.46 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  58.29 
 
 		 365 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  55.25 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  54.97 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  57.1 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.71 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  54.21 
 
 		 367 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.39 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  52.91 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  55.18 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  52.63 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  54.7 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  51.25 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  53.85 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  54.49 
 
 		 369 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  53.69 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.76 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.49 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  54.08 
 
 		 368 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  53.95 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  54.72 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  54.08 
 
 		 368 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.68 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  53.97 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.93 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.34 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  55.12 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  51.52 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.34 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  53.06 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  54.78 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  54.21 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  54.57 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  52.41 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  54.21 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  52.78 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.95 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.08 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.08 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.08 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.08 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.08 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  53.59 
 
 		 351 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 		 370 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.08 
 
 		 388 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  53.39 
 
 		 369 aa  361  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  54.25 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  53.87 
 
 		 369 aa  360  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  54.71 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  50 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  52.92 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.28 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  55.86 
 
 		 371 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  53.06 
 
 		 333 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.28 
 
 		 380 aa  359  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  51.27 
 
 		 367 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  49.03 
 
 		 371 aa  358  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.68 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  51.26 
 
 		 368 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  52.69 
 
 		 332 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  51.69 
 
 		 377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  51.27 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  53.53 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.21 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  52.99 
 
 		 367 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  51.26 
 
 		 368 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 363 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  48.2 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  51.98 
 
 		 332 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  52.97 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  52.38 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 		 373 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  51.05 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.68 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  51.12 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  53.24 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  52.68 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  49.72 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  51.8 
 
 		 333 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.68 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  53.24 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  50.83 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  51.8 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  53.06 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  52.34 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1150  ABC transporter related  53.95 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  51.82 
 
 		 370 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  50.56 
 
 		 377 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.75 
 
 		 362 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  52.37 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>