More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2469 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  100 
 
 		 330 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  67.87 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  65.65 
 
 		 333 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  65.77 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  64.56 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.66 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.36 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  62.46 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  63.25 
 
 		 344 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  56.02 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  61.14 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  56.42 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  57.79 
 
 		 380 aa  378  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  58.45 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  54.65 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.18 
 
 		 335 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  57.22 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  58.64 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.49 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  53.26 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  57.51 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  61.49 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  56.18 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  56.9 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.78 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.02 
 
 		 365 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  54.44 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.49 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  55.42 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  61.49 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  57.1 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  52.33 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  57.75 
 
 		 332 aa  362  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  53.46 
 
 		 369 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  53.46 
 
 		 369 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  56.17 
 
 		 332 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  53.59 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  57.4 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  53.57 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  54.32 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  54.34 
 
 		 377 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.35 
 
 		 369 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  57.01 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 		 333 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.12 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50.69 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.33 
 
 		 368 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.33 
 
 		 368 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  56.46 
 
 		 332 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  55.9 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  54.95 
 
 		 333 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.91 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  57.53 
 
 		 333 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  54.39 
 
 		 361 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  56.42 
 
 		 334 aa  358  8e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.91 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  56.33 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 333 aa  356  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  52.66 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.37 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  54.26 
 
 		 351 aa  355  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 		 373 aa  355  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  55.29 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.51 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  50.56 
 
 		 366 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.75 
 
 		 370 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  54.21 
 
 		 352 aa  355  6.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  53.07 
 
 		 365 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.35 
 
 		 369 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  52.53 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  50.28 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.28 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  55.79 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  55.09 
 
 		 338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  53.17 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.07 
 
 		 368 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  55.06 
 
 		 360 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.17 
 
 		 370 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 395 aa  350  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  52.66 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  56.16 
 
 		 333 aa  350  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  56.16 
 
 		 341 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 370 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 370 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 370 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 370 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  54.71 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  52.54 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  52.66 
 
 		 369 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.57 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0880635  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  57.23 
 
 		 369 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  55.59 
 
 		 332 aa  348  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 		 370 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  54.04 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>