More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7445 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  100 
 
 
371 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  57.07 
 
 
360 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  56.99 
 
 
360 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  53.41 
 
 
367 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  54.55 
 
 
369 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  53.63 
 
 
360 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  53.35 
 
 
360 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  53.19 
 
 
361 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  54.89 
 
 
369 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.35 
 
 
361 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  57.5 
 
 
361 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.28 
 
 
395 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  53.06 
 
 
369 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  56.01 
 
 
368 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  52.79 
 
 
368 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  55.19 
 
 
368 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  55.19 
 
 
368 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  56.67 
 
 
361 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.49 
 
 
357 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
368 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  55.46 
 
 
369 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.59 
 
 
358 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  52.79 
 
 
366 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  54.22 
 
 
368 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  53.97 
 
 
369 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  53.57 
 
 
375 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  52.41 
 
 
369 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 
369 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.62 
 
 
358 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  54.47 
 
 
369 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  51.87 
 
 
369 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  50.97 
 
 
361 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  56.06 
 
 
364 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  52.6 
 
 
369 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.86 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
370 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  50.96 
 
 
372 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.01 
 
 
370 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  55 
 
 
361 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  53.7 
 
 
369 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.76 
 
 
372 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  55.15 
 
 
359 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
388 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 
371 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  53.04 
 
 
357 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  55.31 
 
 
357 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  52.45 
 
 
368 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  53.21 
 
 
384 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  53.55 
 
 
391 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
378 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.95 
 
 
365 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  52.68 
 
 
353 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  51.1 
 
 
377 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.31 
 
 
380 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.39 
 
 
368 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.04 
 
 
376 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
369 aa  362  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50.68 
 
 
370 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  51.64 
 
 
372 aa  359  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  54.04 
 
 
363 aa  358  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  54.86 
 
 
360 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  52.45 
 
 
362 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 
373 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.04 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  50.83 
 
 
380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.33 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.33 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.33 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.33 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.88 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.88 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.33 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.88 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  53.61 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  49.32 
 
 
371 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 
381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  51.23 
 
 
377 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  52.86 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  52.86 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  52.86 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  52.92 
 
 
363 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  52.19 
 
 
362 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  49.45 
 
 
379 aa  354  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  52.88 
 
 
366 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  51.77 
 
 
362 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3244  ABC transporter-related protein  50.79 
 
 
390 aa  352  7e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 
372 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50.14 
 
 
370 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>