More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5080 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  92.93 
 
 		 368 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  100 
 
 		 368 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  73.97 
 
 		 372 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  59.67 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  58.4 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  58.56 
 
 		 363 aa  428  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  56.08 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  56.52 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  57.91 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  56.78 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  56.01 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.79 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  50.96 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  54.19 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  52.96 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  54.78 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.61 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  51.89 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.31 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  56.45 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.51 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  52.23 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  54.82 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  54.49 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  52.81 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  53.19 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  56.39 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  52.41 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  55.06 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  55.11 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  52.81 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.37 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  55.11 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  55.59 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  52.11 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  55.11 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  54.32 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.65 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  52.47 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  54.83 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  54.08 
 
 		 332 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  51.12 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  54.34 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  52.62 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  52.96 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  54.57 
 
 		 351 aa  363  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.11 
 
 		 361 aa  362  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.45 
 
 		 357 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  54.57 
 
 		 352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.81 
 
 		 351 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  52.66 
 
 		 360 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  53.62 
 
 		 344 aa  362  8e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  54.08 
 
 		 352 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.23 
 
 		 349 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.34 
 
 		 369 aa  361  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  58.92 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  53.61 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  55.97 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  53.52 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.56 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  52.82 
 
 		 342 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.11 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  51.77 
 
 		 368 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  51.77 
 
 		 368 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 		 365 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  52.35 
 
 		 375 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  51.91 
 
 		 336 aa  358  9e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.21 
 
 		 369 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  53.72 
 
 		 358 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 333 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.58 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  51.63 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  50.58 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.49 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  52.92 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.99 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.76 
 
 		 333 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  51.9 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  54.37 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.82 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  51.79 
 
 		 350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  54.02 
 
 		 370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.33 
 
 		 376 aa  355  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  55.11 
 
 		 358 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  52.47 
 
 		 377 aa  355  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  52.89 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.33 
 
 		 380 aa  355  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  53.06 
 
 		 332 aa  355  5.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  52.53 
 
 		 372 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  54.96 
 
 		 364 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.88 
 
 		 391 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.25 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>