More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2905 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  100 
 
 
334 aa  684    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  79.28 
 
 
334 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  77.54 
 
 
334 aa  544  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  77.58 
 
 
332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  77.58 
 
 
332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  76.67 
 
 
332 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  70.87 
 
 
332 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  73.33 
 
 
332 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  70.57 
 
 
332 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  71.17 
 
 
333 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  70.27 
 
 
332 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  69.79 
 
 
332 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  71.9 
 
 
332 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  70.09 
 
 
332 aa  477  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  68.15 
 
 
336 aa  464  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  66.67 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  66.77 
 
 
335 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  61.86 
 
 
333 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  59.28 
 
 
333 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.06 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  59.57 
 
 
333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  60.61 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  58.97 
 
 
334 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  59.29 
 
 
338 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  56.11 
 
 
372 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  58.31 
 
 
333 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  57.19 
 
 
342 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.18 
 
 
369 aa  381  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.1 
 
 
333 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  57.98 
 
 
325 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  58.81 
 
 
333 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  57.67 
 
 
325 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  55.59 
 
 
342 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 
333 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  59.89 
 
 
349 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.74 
 
 
368 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  56.19 
 
 
341 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  54.9 
 
 
367 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  54.72 
 
 
370 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  53.07 
 
 
359 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.95 
 
 
332 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  54.02 
 
 
370 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  53.63 
 
 
395 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.23 
 
 
391 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 
370 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  54.55 
 
 
359 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  55.1 
 
 
359 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  56.06 
 
 
333 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  51.4 
 
 
369 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  55.52 
 
 
344 aa  359  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.1 
 
 
362 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  52.1 
 
 
367 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.4 
 
 
369 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.47 
 
 
365 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.11 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  51.69 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  52.94 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.97 
 
 
375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  54.13 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  55.49 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  54.37 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  54.08 
 
 
368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  52.53 
 
 
377 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.39 
 
 
373 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  52.53 
 
 
377 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
378 aa  353  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.12 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 
369 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 
369 aa  352  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 
369 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  50.71 
 
 
359 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  53.78 
 
 
364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  53.07 
 
 
357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  56.1 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  53.07 
 
 
368 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  54.68 
 
 
349 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  50 
 
 
369 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  50.98 
 
 
362 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  53.09 
 
 
365 aa  349  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  52.92 
 
 
361 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  52.11 
 
 
377 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  52.38 
 
 
362 aa  348  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  50.7 
 
 
366 aa  348  5e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  49.58 
 
 
353 aa  348  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  52.56 
 
 
374 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.82 
 
 
370 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 
370 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  49.44 
 
 
369 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  51.69 
 
 
377 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  49.72 
 
 
369 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
370 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
370 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
370 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
388 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
370 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  49.72 
 
 
369 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.2 
 
 
376 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  53.64 
 
 
350 aa  346  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  50 
 
 
368 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>