More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0971 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  100 
 
 		 334 aa  683    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  81.68 
 
 		 334 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  77.54 
 
 		 334 aa  544  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  75.76 
 
 		 332 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  75.76 
 
 		 332 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  74.24 
 
 		 332 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  74.85 
 
 		 332 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  72.07 
 
 		 332 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  72.12 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  70.27 
 
 		 333 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  70.24 
 
 		 332 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  70.39 
 
 		 332 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  69.64 
 
 		 332 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  68.58 
 
 		 338 aa  471  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  67.98 
 
 		 332 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  67.96 
 
 		 336 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  65.57 
 
 		 335 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  59.7 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  59.7 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  60.3 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.18 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.48 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  57.8 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  58.1 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  59 
 
 		 338 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  59.2 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  58.59 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  58.61 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  58.13 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.04 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.73 
 
 		 333 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  58.43 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  56.5 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  54.62 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.19 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  52.91 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  57.88 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  59.09 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  55.15 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  53.5 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  57.1 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.78 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  54.62 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  53.78 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  52.69 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.18 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.19 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  54.73 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.71 
 
 		 395 aa  361  9e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  53.5 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  53.52 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.12 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  51.94 
 
 		 370 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  53.78 
 
 		 362 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  52.56 
 
 		 361 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  54.65 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  56.42 
 
 		 330 aa  358  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  55.95 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  57.91 
 
 		 375 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  56.93 
 
 		 349 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  52.94 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  54.08 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  55.01 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  52.23 
 
 		 359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.69 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 		 370 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.55 
 
 		 332 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  54.08 
 
 		 368 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.54 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  51.52 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  52.81 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  54.17 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  55.06 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.52 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  54.78 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  57.1 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  57.1 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  53.57 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  57.1 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  53.19 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.06 
 
 		 373 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  53.89 
 
 		 376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  52.91 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.92 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  50.84 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  50.84 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  50.84 
 
 		 369 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  52.56 
 
 		 361 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  55.38 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  55.36 
 
 		 338 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  51.4 
 
 		 369 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  55.06 
 
 		 359 aa  348  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  51.12 
 
 		 368 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  51.12 
 
 		 368 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  53.2 
 
 		 350 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  51.56 
 
 		 364 aa  348  8e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  52.09 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  51.12 
 
 		 369 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  55.7 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>